Para começar, ative o ambiente Conda inserindo o comando no terminal. Use o comando para abrir um bloco de anotações Python interativo. Crie um novo bloco de anotações Python na pasta desejada, fornecendo um nome apropriado.
Em seguida, importe o arquivo Python que contém as funções de alinhamento executando o comando na primeira célula. Se estiver usando dados de brotamento como os dados da fase do ciclo celular. Importe um quadro de dados contendo a porcentagem de movimento em cada ponto de tempo executando o comando em uma nova célula.
Em seguida, alinhe os dados emergentes a uma escala de tempo de ponto de linha de vida inserindo a função em uma nova célula. Em seguida, importe o quadro de dados experimental para o bloco de anotações executando o comando em uma nova célula. Alinhe os dados experimentais a uma escala de ponto de tempo da linha de vida inserindo a função em uma nova célula.
Em seguida, insira o comando em uma nova célula para baixar o conjunto de dados alinhado à linha de vida. Os dados de brotamento coletados do RNAseq da Condição 2 mostraram a porcentagem atingida ao longo do tempo tanto para a escala de tempo não alinhada em minutos, quanto para a escala de tempo alinhada em pontos de linha de vida. Os dados de citometria de fluxo coletados para o conjunto de dados da Condição 2 plotados para um ponto de tempo selecionado mostraram que os dados correspondiam à fase determinada pelo alinhamento.
