Para acessar os plugins de código aberto para análises de Autofluorescência Quantitativa ou QAF, no software Fiji. Clique em Gerenciar sites de atualização para adicionar o site de atualização de computação criativa exibido aos sites de atualização pré-existentes. Para instalar o plug-in de pipeline Spectralis, baixe os plug-ins e reinicie Fiji.
Os diferentes plugins do Spectralis estarão localizados no menu suspenso de plugins no lote Spectralis ou Spectralis. Os arquivos de exportação XML do Spectralis QAF armazenados no formato vermelho, verde, azul ou RGB são limitados a uma escala de valor AF medido de zero a 255 e incluem regiões de calibração padrão e preta. Para produzir uma imagem QAF, abra o menu suspenso de plug-ins.
Clique em Spectralis, selecione o leitor de XML QAF e descarte a tela de abertura. Uma nova janela mostrando o prompt, escolha um diretório contendo uma exportação XML QAF espectral aparecerá. Selecione o diretório e clique em selecionar.
Na janela, os parâmetros do QAF inserem o fator de calibração de referência ou RCF incluído nas informações da imagem e a idade do paciente no momento da obtenção da imagem. Depois de clicar em OK, quando um mapa pop-up rotulado para oito bits aparecer, insira o valor mínimo de QAF ou QAF mínimo e o valor máximo de QAF ou QAF máximo para uma imagem QAF codificada por cores. Para adicionar uma imagem de cada vez em plugins, selecione Spectralis seguido de adicionar à retina_OCT padrão e descarte a tela de abertura.
Quando uma janela for exibida, escolha um diretório que contenha uma exportação XML da OCT do Spectralis. Selecione a pasta e clique em selecionar para abrir o BScan. Depois que o volume da OCT for carregado e o prompt, escolha um diretório contendo imagens en Face registradas, será exibido.
Selecione a pasta apropriada e clique em selecionar. Nesta fase, três janelas aparecerão. Um rotulado en Face stack, exibindo as imagens empilhadas da pasta selecionada.
A segunda pilha BScan rotulada, exibindo a varredura OCTB, e a média ou terceira rotulada escolher modalidade. Selecione uma modalidade na pilha en Face. Como uma nova janela com o prompt, escolha um diretório contendo a retina padrão aparece, selecione ou crie o diretório contendo retina padrão.
Examine a nova retina padrão, role e mova o cursor para exibir a média e o desvio padrão para esse local específico. Clique no botão Aceitar para adicionar a foto mais recente à retina padrão ou descartá-la. Para adicionar várias imagens ao mesmo tempo usando Batch_QAF_ retina padrão primeiro, prepare um manifesto.
txt na mesma pasta que os IDs de maiúsculas e minúsculas. O caminho relativo do local do arquivo dot txt para a OCT e a pilha enFace deve ser listado e separado por um espaço de tabulação sem qualquer espaço em branco adicional antes e depois dos nomes. Para percorrer a pilha BScan, arraste a barra na parte inferior para a esquerda ou direita, ou selecione o quadro BScan e use as teclas de seta para a esquerda e para a direita no teclado.
Uma visão geral da área atual da pilha BScan é fornecida pela linha vermelha na janela da pilha enFace e no canto superior esquerdo da janela BScan onde o número BScan é exibido. Para marcar uma região, selecione marcar no segmento de linha de desenho na janela BScan e comece clicando com o botão direito do mouse e arrastando o cursor do mouse até o final da lesão. Pressione a tecla de mais para ampliar e a tecla de subtração para reduzir.
Por fim, clique em OK para marcar a região de interesse. A imagem QAF de um olho de um paciente de 84 anos com degeneração macular relacionada à idade intermediária, mostrou uma singular drusa mole marcada. Um closeup da área mostrou um centro marrom representando a drusa marcada, e faixas coloridas representando os buracos ISO circundantes.
O arquivo de saída continha o ID do caso, a lateralidade do arquivo e a modalidade de imagem escolhida. Cada fileira referia-se a um orifício ISO, cujas distâncias da borda externa da lesão foram especificadas nas colunas inferior e superior da planilha. As medidas do QAF continham a mediana mínima e os valores máximos de um pixel em um orifício ISO, o número de pixels, o valor médio do pixel e o desvio padrão da média.
A imagem QAF de um olho de um paciente de 80 anos com degeneração macular precoce relacionada à idade mostrou depósitos drusenoides sub-retinianos. Ao redor de cada lesão demarcada, os orifícios ISO foram representados com codificação colorida.
