Para começar, inicie o software 3D Slicer. Para entrada de imagem dos locais de erosão óssea identificados, clique no botão Dados na janela da segmentação de dados 3D. Em seguida, pressione Escolher arquivos para adicionar e localize imagens individuais para adicionar os arquivos.
Para importar um diretório inteiro de imagens de uma só vez, pressione a opção Escolher diretório para adicionar e, em seguida, pesquise e insira o diretório preferencial. Em seguida, clique no menu suspenso da barra de ferramentas do 3D Slicer. Passe o cursor sobre os módulos de análise óssea e clique em Máscara Automática.
Na guia Etapa 2 Máscara Automática, escolha um volume de entrada no menu suspenso Volume de entrada. Selecione Criar Novo Volume de Mapa de Rótulo no menu suspenso de segmentação de saída. Se preferir outro rótulo de saída, clique em Criar novo volume de mapa de rótulo como e forneça o rótulo desejado.
Insira o número de bones a serem mascarados na caixa de texto fornecida e selecione ORMR ou Dual Threshold no menu suspenso do algoritmo. Clique em Obter máscara para executar o algoritmo e gerar um resultado no diretório de imagem correspondente. Se a imagem contiver vários ossos, uma máscara separada será salva para cada um.
Para importar uma máscara binária para a segmentação de dados 3D, copie os arquivos de máscara para o diretório de máscaras de carga localizado na pasta BAM. Volte para a janela do 3D Slicer e clique na guia Step 3 Manual Correction. Para carregar os arquivos de máscara e convertê-los automaticamente em segmentações de segmentação de dados, clique em Carregar.
Para fazer alterações na máscara, use as ferramentas fornecidas na guia de correção manual. Para iniciar a análise estatística, clique no módulo de volume de erosão no menu suspenso na barra de ferramentas. Carregue uma imagem e sua máscara correspondente.
Selecione a imagem e a máscara de entrada, crie uma segmentação de saída e coloque os pontos de semente na erosão. Clique no botão Obter erosões para iniciar o algoritmo de medição de erosão. Se o tamanho e a forma dos volumes de erosão detectados automaticamente não forem satisfatórios, edite-os manualmente na guia Etapa 5 Correção manual.
Agora clique na guia chamada Estatísticas da Etapa 6 para exportar os dados do computador para um arquivo de planilha. Em seguida, insira o volume de erosão no menu suspenso rotulado Erosões de entrada. Agora forneça a imagem em escala de cinza e sua largura de voxel em milímetros na caixa de texto no menu de volume mestre.
Clique em Obter estatísticas para gerar um arquivo de planilha no diretório de dados de saída de erosões localizado na pasta BAM.
