1 Para começar, inicie o software Cytoscape 3.9.12 na área de trabalho e importe o arquivo tsv 3 contendo as principais proteínas do eczema do ânus. 4 Clique na barra de estilo no painel de controle 5 para otimizar a cor, a fonte e o tamanho dos nós da rede. 6 Para análise de topologia de rede, 7 empregue a função de análise de rede.
8 Para obter genes hub, use CytoHubba 9 e estabeleça a rede alvo da doença componente do medicamento. 10 Abra o site do Metascape. 11 Selecione um arquivo ou cole uma lista de genes na caixa de diálogo 12 e clique no botão enviar.
13 Em seguida, selecione H.sapiens na entrada como espécie 14 e na análise como espécie, 15 e ative a função de análise personalizada. 16 Na opção de enriquecimento, 17 selecionam funções moleculares GO, processos biológicos GO, 18 componentes celulares GO e o banco de dados KEGG Pathway. 19 Marque a escolha de clusters GO seletivos, 20 e clique no botão de análise de enriquecimento.
21 Após a conclusão da barra de progresso, 22 inicie uma página de relatório de análise e clique em 23 para recuperar os resultados do enriquecimento. 24 Abra a ferramenta GEO2R para pesquisar 25 e analisar o banco de dados de chips genéticos GEO. 26 Abra o site do banco de dados GEO.
27 Em seguida, digite a palavra-chave ou acesso GEO 28 e clique no botão de pesquisa. 29 Selecione o melhor resultado correspondente, 30 e encontre a série de referência. 31 Agora, no site da ferramenta GEO2R, 32 insira a série de referência na caixa de acesso GEO 33 e clique no botão set.
34 Selecione dermatite atópica como grupo experimental 35 e controle não atópico como grupo controle. 36 Clique no botão analisar e aguarde até que os resultados apareçam. 37 análises de enriquecimento KEGG e GO de 59 alvos-chave 38 identificaram 218 vias e mais de 3.000 processos biológicos, 39 destacando vias significativas nos ODS e eczema anal.
40 A análise GO em processos biológicos, composição celular, 41 e função molecular 42 enfatizou alvos comuns no SDG e no eczema anal. 43 As funções biológicas relevantes incluíam fosforilação de peptidil-tirosina 44 e regulação da adesão célula-célula.
