Sequenciamento e Identificação de Microbiota de Biofilme Multiespécie a partir de Amostras da Rizosfera

Para começar, estabeleça um biofilme de rizosfera multiespécies e obtenha a suspensão de células da microbiota. Misture o meio de caldo de soja tríptico com o mínimo de sais de glicerol e glutamato na proporção de um para um. Incube a suspensão celular no meio a 30 graus Celsius durante a noite para ativar a bactéria.

Coloque filtros de células de nylon de 100 micrômetros em uma placa de 24 poços. Inocular a suspensão bacteriana em três repetições e cultivar o biofilme da película durante 36 horas a 30 graus Celsius. Remova o filtro que contém o biofilme da película e adicione dois mililitros de tampão PBSS a uma nova placa de células de 24 poços.

Coloque o filtro na placa para lavar o biofilme e remover as células livres. Após a identificação e cultivo das cinco principais espécies no biofilme, incubar as 31 combinações de comunidades sintéticas no meio. Seguindo o procedimento mencionado, foram observados gradientes significativos na capacidade de formação de biofilme da microbiota do solo da rizosfera do pepino.

O sequenciamento do amplicon de biofilme confirmou a presença de várias espécies na película.