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Abstract

Biology

快速荧光

Published: November 26th, 2014

DOI:

10.3791/52053

1Division of Reproductive Sciences, Cincinnati Children's Hospital Medical Center, 2Department of Pediatrics, University of Cincinnati College of Medicine

* These authors contributed equally

Abstract

原位杂交(FISH)用免疫荧光(免疫FISH)结合的RNA的荧光创建可以在单细胞水平被用于检测RNA的定位与同步洞察的空间动态成 ​​蛋白质,表观遗传修饰和其他细节的定位技术这可以通过免疫荧光被突出显示。 X染色体失活是一个范例长非编码RNA(lncRNA)介导的基因沉默。的X不活动的特定转录物(Xist的)lncRNA积累(称为Xist的云)上的两个X染色体在哺乳动物雌性之一是启动的X染色体失活的一个关键步骤。 Xist的核糖核酸直接或间接地与各种染色质修饰酶相互作用并引入不同的后生景观的失活的X染色体(十一)。在西安一个已知的后生特点是组蛋白H3三甲基赖氨酸27(H3K27me3)修改。在这里,我们描述了一个简单而快速的免疫FISH协议利用RNA FISH配上H3K27me3的免疫多个寡核苷酸探针检查Xist的RNA的定位及相关表观遗传修饰检测Xist的RNA。使用寡核苷酸探针的结果在较短的培养时间和更灵敏的检测Xist的核糖核酸的相比在体外转录的RNA探针(核糖探针)。这个协议提供了一个有力的工具用于理解lncRNAs的动力学和其相关联的表观遗传修饰,染色质结构,核组织和转录调控。

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93 Xist X RNA

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