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Neuroscience

FIM成像和FIMtrack:两个新的工具允许高吞吐量和成本效益分析步态

Published: December 24th, 2014

DOI:

10.3791/52207

1Institute of Neuro and Behavioral Biology, Westfälische Wilhelms-Universität Münster, 2Department of Mathematics and Computer Science, Westfälische Wilhelms-Universität Münster
* These authors contributed equally

神经元网络功能的分析需要的行为特征的可靠测量。由于自由活动动物的行为是可变到一定程度,许多动物都进行分析,以获得统计学显著数据。这又需要的运动模式的计算机辅助自动定量。以获得几乎半透明和小型移动物体的高对比度图像,基于受抑全内反射称为FIM一种新颖的成像技术被开发。在此设置中,将动物仅在与下面的爬行表面接触的非常具体的位置照射红外光。这种方法导致了非常高的对比度的图像。随后,这些高对比度图像是使用建立轮廓跟踪算法处理。在此基础上,我们开发了FIMTrack软件,其用于提取数的所需特性来定量描述了大量的各种运动的特点。在这个软件包的发展,我们专注于一个开源的架构,允许轻松添加更多的模块我们的努力。程序的操作独立于平台,并伴随着一个直观的图形用户界面引导通过数据分析该用户。所有的运动参数值给出了CSV文件,允许进一步的数据分析形式。此外,结果查看器集成到跟踪软件提供了机会,交互审查并调整输出,可能在刺激整合是必要的。 FIM和FIMTrack的动力表现在研究果蝇幼虫的运动。

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