FIM Imaging en FIMtrack: Twee nieuwe instrumenten die High-throughput en Rendabele Locomotion Analyse

De analyse van neuronale netwerk functie vereist een betrouwbare meting van gedragskenmerken. Aangezien het gedrag van vrij bewegende dieren variabele in zekere mate, veel dieren moeten worden geanalyseerd om statistisch significante gegevens te verkrijgen. Dit vereist op zijn beurt een computerondersteund geautomatiseerde kwantificering van de motoriek patronen. Om een ​​hoog contrast van bijna doorschijnend en kleine bewegende objecten te verkrijgen, een nieuwe beeldvormingstechniek op basis van gefrustreerde totale interne reflectie genoemd FIM werd ontwikkeld. In deze opstelling worden de dieren alleen verlicht met infrarood licht op de zeer specifieke positie van het contact met het onderliggende kruipen oppervlak. Deze methode resulteert in een zeer hoog contrast. Vervolgens worden deze contrastrijke beelden verwerkt met behulp van gevestigde contour volgen algoritmen. Op basis hiervan ontwikkelden we de FIMTrack software, waarvan een aantal functies die nodig extract kwantitatief beschrijven een grote verscheidenheid van voortbewegingkenmerken. Tijdens de ontwikkeling van deze software pakket, we onze inspanningen gericht op een open source architectuur waardoor de eenvoudige toevoeging van verdere modules. Het programma werkt platformonafhankelijk en gaat vergezeld van een intuïtieve GUI die de gebruiker door middel van data-analyse. Alle motoriek parameter waarden worden gegeven in de vorm van csv-bestanden waardoor verdere data-analyses. Bovendien a Resultaten Viewer geïntegreerd in de tracking software biedt de mogelijkheid om interactief te beoordelen het uitgangsniveau, zoals nodig kunnen zijn tijdens stimulus integratie. De kracht van FIM en FIMTrack wordt aangetoond door het bestuderen van de beweging van de Drosophila larven.