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Neuroscience

FIM Imaging und FIMtrack: Zwei neuer Instrumente, die Hochdurchsatz und Kosteneffektiv Locomotion Analyse

Published: December 24th, 2014

DOI:

10.3791/52207

1Institute of Neuro and Behavioral Biology, Westfälische Wilhelms-Universität Münster, 2Department of Mathematics and Computer Science, Westfälische Wilhelms-Universität Münster
* These authors contributed equally

Die Analyse der neuronalen Netzwerkfunktion erfordert eine zuverlässige Messung der Verhaltensmerkmale. Da das Verhalten von frei umherlaufenden Tieren variabel ist, um einem gewissen Grad haben viele Tiere analysiert, um statistisch signifikante Daten zu erhalten. Dies wiederum erfordert eine computergestützte automatische Quantifizierung von Bewegungsmustern. Um Bilder mit hohem Kontrast von fast durchsichtig und kleine bewegte Objekte zu erhalten, wurde ein neuartiges bildgebendes Verfahren auf Basis von frustrierten Totalreflexion genannt FIM entwickelt. In dieser Konfiguration werden die Tiere nur mit Infrarotlicht an der sehr spezifischen Lage der Kontakt mit der darunter kriechen Fläche beleuchtet. Diese Methode führt zu einem sehr kontrastreiche Bilder. Anschließend werden diese Bilder mit hohem Kontrast mit etablierten Konturverfolgungsalgorithmen verarbeitet. Die FIMTrack Software, die eine Anzahl von Merkmalen benötigt extrahieren quantitativ zu beschreiben eine große Vielzahl von Bewegungs dient auf dieser Basis haben wirEigenschaften. Bei der Entwicklung dieser Software-Paket, konzentrieren wir unsere Bemühungen auf einem Open Source-Architektur ermöglicht die einfache Zugabe von weiteren Modulen. Das Programm arbeitet plattformunabhängig und wird durch eine intuitive Benutzeroberfläche, die den Benutzer über die Datenanalyse begleitet. Alle Bewegungsparameterwerte werden in Form von csv-Dateien die eine weitere Datenanalysen gegeben. Darüber hinaus bietet ein Ergebnisviewer in die Tracking-Software integriert die Möglichkeit, interaktiv überprüfen und stellen Sie den Ausgangs, wie man während der Stimulus-Integration erforderlich sein. Die Macht der FIM und FIMTrack wird durch das Studium der Fortbewegung von Drosophila-Larven zeigte.

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