JoVE Logo
Faculty Resource Center

Sign In

Abstract

Neuroscience

FIM הדמיה וFIMtrack: שני כלים חדשים המאפשר תפוקה גבוהה וניתוח תנועה חסכוני

Published: December 24th, 2014

DOI:

10.3791/52207

1Institute of Neuro and Behavioral Biology, Westfälische Wilhelms-Universität Münster, 2Department of Mathematics and Computer Science, Westfälische Wilhelms-Universität Münster
* These authors contributed equally

הניתוח של פונקצית רשת עצבית דורש מדידה אמינה של תכונות התנהגותיות. מאז ההתנהגות של בעלי חיים לנוע בחופשיות היא משתנה במידה מסוימת, בעלי חיים רבים צריכים להיות מנותחים, כדי לקבל נתונים משמעותיים מבחינה סטטיסטית. זה בתורו דורש כימות אוטומטי בעזרת מחשב של דפוסי תנועה. כדי להשיג תמונות עם ניגודיות גבוהות של אובייקטים נעים כמעט שקופים וקטנים, טכניקת הדמיה חדשנית המבוססת על ההשתקפות פנימית מוחלטת מתוסכלת נקראת FIM פותחה. בהגדרה זו, בעלי חיים מוארים רק באור אינפרא אדום במיקום מאוד ספציפי של מגע עם משטח הזחילה הבסיסי. מתודולוגיה זו תוצאה תמונות עם ניגודיות גבוהות מאוד. בהמשך לכך, תמונות עם ניגודיות גבוהות אלה מעובדות באמצעות אלגוריתמי מעקב גובה הוקמו. על בסיס זה, פיתחנו את תוכנת FIMTrack, המשמשת כדי לחלץ מספר התכונות הדרושות כדי לתאר מגוון רחב של תנועת כמותיתמאפיינים. במהלך הפיתוח של חבילת תוכנה זו, אנו מתמקדים המאמצים שלנו על ארכיטקטורת קוד פתוחה המאפשרת בנוסף קל של מודולים נוספים. התכנית פועלת פלטפורמה עצמאית והוא מלווה על ידי ממשק גרפי אינטואיטיבי המנחה את המשתמש באמצעות ניתוח נתונים. מקבלים את כל ערכי פרמטר תנועה בצורה של קבצי csv מאפשרים נתונים נוספים מנתח. בנוסף, מציג תוצאות שולבו בתוכנת המעקב מספק ההזדמנות לבחון באופן אינטראקטיבי ולהתאים את התפוקה, כפי שניתן היה הצורך במהלך האינטגרציה גירוי. כוחו של FIM וFIMTrack בא לידי ביטוי על ידי לימוד התנועה של זחלים תסיסנית.

Explore More Videos

Neuroscience

This article has been published

Video Coming Soon

JoVE Logo

Privacy

Terms of Use

Policies

Research

Education

ABOUT JoVE

Copyright © 2024 MyJoVE Corporation. All rights reserved