FIM Imaging e FIMtrack: due nuovi strumenti che ad alta produttività e costo effettivo Locomotion Analysis

L'analisi della funzione di rete neuronale richiede una misura affidabile di tratti comportamentali. Poiché il comportamento degli animali liberi di muoversi è variabile in una certa misura, molti animali devono essere analizzati per ottenere dati statisticamente significativi. Questo a sua volta richiede un computer assistita quantificazione automatizzata di modelli locomozione. Per ottenere immagini ad alto contrasto di oggetti in movimento quasi traslucidi e piccoli, è stata sviluppata una tecnica di imaging romanzo basato sulla riflessione interna totale chiamato FIM. In questa configurazione, gli animali sono illuminate solo con luce infrarossa nella posizione molto specifico di contatto con la superficie sottostante scansione. Questa metodologia si traduce in immagini molto alto contrasto. Successivamente, queste immagini ad alto contrasto vengono elaborate utilizzando algoritmi di monitoraggio contorno stabiliti. Sulla base di questo, abbiamo sviluppato il software FIMTrack, che serve ad estrarre un numero di caratteristiche necessarie per descrivere quantitativamente una grande varietà di locomozioneCaratteristiche. Durante lo sviluppo di questo pacchetto software, abbiamo concentrato i nostri sforzi su un'architettura open source che permette la facile aggiunta di ulteriori moduli. Il programma funziona piattaforma indipendente ed è accompagnata da un interfaccia grafica intuitiva che guida l'utente attraverso l'analisi dei dati. Tutti i valori di parametro locomozione sono espressi in forma di file CSV, per permettere ulteriori analisi dei dati. Inoltre, un visualizzatore Risultati integrato nel software di monitoraggio fornisce l'opportunità di rivedere in modo interattivo e regolare l'uscita, come potrebbe essere necessario durante l'integrazione di stimolo. Il potere di FIM e FIMTrack è dimostrato studiando la locomozione di Drosophila larve.