FIMイメージングとFIMtrack：高スループットとコスト効果的な歩行分析を可能に二つの新しいツール

神経細胞のネットワーク機能の解析は、行動特性の信頼性の高い測定が必要です。自由に動く動物の行動はある程度可変であるため、多くの動物は、統計的に有意なデータを得るために、分析されなければならない。これは次に歩行パターンのコンピュータ支援自動化された定量化が必要です。ほぼ半透明と小さな移動物体の高コントラスト画像を得るために、FIMと呼ばれる減衰全反射に基づく新規なイメージング技術を開発した。このセットアップでは、動物は、基礎となるだけクローリング面と接触の非常に特定の位置に赤外光で照明される。この方法は、非常に高いコントラストの画像が得られる。続いて、これらの高コントラスト画像は、確立された輪郭追跡アルゴリズムを使用して処理される。これに基づいて、我々は、定量的運動の多種多様を記述するために必要な機能の数を抽出するのに役立つFIMTrackソフトウェアを開発特性。このソフトウェアパッケージの開発中に、我々はさらにモジュールを簡単に追加できるように、オープンソースのアーキテクチャ上の私たちの努力を集中した。プログラムは、プラットフォームに依存しないで動作し、データ解析を介してユーザを案内する直感的なGUIを伴う。すべての運動パラメータ値は、更なるデータ分析許可のcsvファイルの形式で与えられている。また、追跡ソフトウェアに統合結果ビューアは、対話的に見直し、刺激の統合の際に必要になる可能性があるとして、出力を調整する機会を提供する。 FIMとFIMTrackの電力がショウジョウバエ幼虫の運動を研究することによって実証される。