FIM Imaging and FIMtrack: Duas novas ferramentas que permitam de alta capacidade e Análise de Custo Efetivo Locomotion

A análise da função rede neuronal requer uma medição confiável de traços comportamentais. Uma vez que o comportamento dos animais que se deslocam livremente é variável até um certo grau, muitos animais têm de ser analisados, para se obter dados estatisticamente significativos. Este, por sua vez, exige um computador assistida quantificação automática de padrões de locomoção. Para obter imagens de alto contraste de objetos que se movem quase translúcidas e pequenos, foi desenvolvida uma nova técnica de imagem baseada na reflexão interna total frustrada chamado FIM. Nesta configuração, os animais são apenas iluminado com luz infravermelha na posição muito específica de contato com a superfície crawling subjacente. Esta metodologia resulta em imagens de contraste muito alto. Posteriormente, estas imagens de alto contraste são processados ​​usando algoritmos de rastreamento de contorno estabelecidas. Com base nisto, foi desenvolvido o software FIMTrack, que serve para extrair uma série de recursos necessários para descrever, quantitativamente uma grande variedade de locomoçãocaracterísticas. Durante o desenvolvimento deste pacote de software, nós nos concentramos nossos esforços em uma arquitetura de código aberto que permite a fácil adição de novos módulos. O programa funciona independente de plataforma e é acompanhada por uma interface gráfica intuitiva guiando o usuário através de análise de dados. Todos os valores de parâmetros de locomoção são dadas em forma de arquivos CSV que permitam uma maior análise dos dados. Além disso, um visualizador de resultados integrados no software de rastreamento fornece a oportunidade de rever de forma interativa e ajustar a saída, pois pode ser necessária durante a integração de estímulo. O poder de FIM e FIMTrack é demonstrada pelo estudo da locomoção de larvas de Drosophila.