FIM изображений и FIMtrack: Два новых инструментов, позволяющих с высокой пропускной способностью и анализ экономической эффективности опорно-двигательного

Анализ функции нейронов сети требуется надежное измерение поведенческих черт. Поскольку поведение свободно подвижных животных является переменной в некоторой степени, многие животные должны быть проанализированы, чтобы получить статистически значимые данные. Это, в свою очередь, требует помощи компьютера автоматизированного количественного моделей передвижения. Чтобы получить высокую контрастность изображения практически прозрачных и мелких движущихся объектов, был разработан метод роман изображений на основе нарушенного полного внутреннего отражения под названием FIM. В этой установке, животные светятся только с инфракрасным светом очень конкретной позиции контакта с подстилающей поверхностью сканирования. Эта методика приводит к очень высоких контрастных изображений. Впоследствии, эти высокие контрастность изображения обрабатываются с помощью установленных алгоритмов отслеживания контура. Исходя из этого, мы разработали программное обеспечение FIMTrack, который служит для извлечения ряд особенностей, необходимых для количественного описания большое разнообразие передвиженияхарактеристики. В ходе разработки данного программного пакета, мы сосредоточили наши усилия на архитектуре с открытым исходным кодом, позволяющей легко добавлять дополнительных модулей. Программа работает независимо от платформы и сопровождается интуитивно понятным графическим интерфейсом, направляющей пользователя через анализа данных. Все значения параметров двигательной приведены в виде CSV-файлов, позволяющих дается дальнейший анализ данных. Кроме того, результаты просмотра интегрированы в программное обеспечение для отслеживания дает возможность в интерактивном режиме пересмотреть и скорректировать выход, как могут понадобиться во время интеграции стимула. Мощность FIM и FIMTrack показано при изучении локомоции личинок дрозофилы.