FIM Imaging y FIMtrack: Dos nuevas vías que hagan de alto rendimiento y Análisis de Costo Efectivo Locomoción

El análisis de la función de red neuronal requiere una medición fiable de los rasgos de comportamiento. Dado que el comportamiento de los animales en movimiento libre es variable a un cierto grado, muchos animales tienen que ser analizados, para obtener datos estadísticamente significativos. Esto a su vez requiere una asistido por ordenador cuantificación automática de patrones de locomoción. Para obtener imágenes de alto contraste de objetos que se mueven casi translúcidos y pequeñas, se desarrolló una nueva técnica de imagen basada en frustrado reflexión total interna llamada FIM. En esta configuración, los animales sólo se iluminan con luz infrarroja en la posición muy específica de contacto con la superficie de rastreo subyacente. Esta metodología resulta en imágenes de muy alto contraste. Posteriormente, estas imágenes de alto contraste se procesan mediante algoritmos de seguimiento de contorno establecidas. Basados ​​en esto, hemos desarrollado el software FIMTrack, que sirve para extraer una serie de características necesarias para describir cuantitativamente una gran variedad de locomocióncaracterísticas. Durante el desarrollo de este paquete de software, nos hemos centrado nuestros esfuerzos en una arquitectura de código abierto que permite la fácil adición de nuevos módulos. El programa funciona independiente de la plataforma y se acompaña de una GUI intuitiva guiar al usuario a través de análisis de datos. Todos los valores de los parámetros de locomoción se dan en forma de archivos CSV que permite análisis más datos. Además, un visor de Resultados integrado en el software de seguimiento proporciona la oportunidad de revisar y ajustar la salida, como podría ser necesario durante la integración de estímulos de forma interactiva. El poder de FIM y FIMTrack se demuestra mediante el estudio de la locomoción de larvas de Drosophila.