Estrazione e l'analisi delle microbica fosfolipidi acidi grassi nei terreni

Gli acidi grassi fosfolipidi (PLFAs) sono componenti chiave delle membrane cellulari microbiche. L'analisi dei PLFAs estratto da terreni in grado di fornire informazioni sulla struttura complessiva delle comunità microbiche terrestri. PLFA profiling è stato ampiamente utilizzato in una vasta gamma di ecosistemi come un indice biologico della qualità complessiva del suolo, e come indicatore quantitativo di risposta del terreno alla gestione del territorio e altri fattori di stress ambientali.

Il metodo standard qui presentata delinea quattro fasi fondamentali: 1. l'estrazione del grasso da campioni di terreno con una miscela di cloroformio monofase, 2. frazionamento con colonne di estrazione in fase solida per isolare fosfolipidi di altri lipidi estratti, 3. metanolisi di fosfolipidi per la produzione di acidi grassi esteri metilici (fames), e 4. analisi FAME mediante gascromatografia capillare utilizzando un rilevatore a ionizzazione di fiamma (GC-FID). Due standard sono utilizzati, tra cui 1,2-dinonadecanoyl- SN -glycero-3-phosphocholine (PC (19:0/19: 0)) per valutare il recupero complessivo del metodo di estrazione, e metil decanoato (MeC10: 0) come standard interno (ISTD) per l'analisi GC.