Терруар Концепция толкуется через виноградной ягоды метаболомики и транскриптомика

Терруар относится к сочетанию факторов внешней среды , которые влияют на характеристики культур , таких как виноградной лозы (Vitis Vinifera) в соответствии с конкретной среды обитания и практики управления. В данной статье показано, как некоторые сигнатуры терруар могут быть обнаружены в ягодного метаболом и транскриптома виноградной лозы сорта Corvina с использованием многомерного статистического анализа. Метод сначала требует соответствующего плана отбора проб. В данном примере, конкретный клон сорта Corvina был выбран, чтобы свести к минимуму генетические различия, и образцы были собраны из семи виноградников, представляющих три различных макро-зоны в течение трех сезонов роста. Нецелевой ЖХ-МС метаболомика подход рекомендуется из-за его высокой чувствительности, сопровождается эффективной обработки данных с использованием программного обеспечения MZmine и стратегию идентификации метаболита, основанный на анализе фрагментации дерева. Комплексный анализ транскриптом может быть достигнуто с использованием микрочиповсодержащие зонды покрытия ~ 99% всех предсказанных генов виноградной лозы, что позволяет одновременный анализ всех дифференциально выраженных генов в контексте различных терруара. И, наконец, многомерный анализ данных на основе проекционных методов могут быть использованы для преодоления сильного марочные конкретного эффекта, что позволяет метаболомика и данные транскриптомика быть интегрированы и детально проанализированы с целью выявления информативных корреляции.