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Biochemistry

Halbautomatische Biopanning bakterielle Anzeige Bibliotheken für Peptid Affinität Reagenz Entdeckung und Analyse der daraus resultierenden Isolate

Published: December 6th, 2017

DOI:

10.3791/56061

1Sensors and Electron Devices Directorate, US Army Research Laboratory

Biopanning bakterielle Anzeige Bibliotheken ist eine bewährte Technik für Peptid Affinität Reagenz Entdeckung für die Anerkennung von biotischen und abiotischen Zielen. Peptid Affinität Reagenzien eignet sich für ähnliche Anwendungen, Antikörper, einschließlich der Erkennung und Therapie, sondern sind robuster und in extremen Umgebungen mehr durchführen. Spezifische Anreicherung von Peptid-Capture Agenten zu einem Protein-Ziel von Interesse wird verstärkt mit semi-automatischen Sortierverfahren, die Bindung zu verbessern und Schritte zu waschen und daher verringern das Auftreten von falsch positiven Bindemittel. Eine halbautomatische Sortierung ist beschrieben hierin für den Einsatz mit einer kommerziellen automatisierte magnetisch aktivierte Zelle Sortierung Gerät mit einer ungezwungenen bakterielle Anzeige sortieren Bibliothek zufällige 15-Mer Peptide zum Ausdruck zu bringen. Mit geringfügigen Änderungen, diese Methoden sind erweiterbar auf andere automatische Geräte, andere Sortierung Bibliotheken und anderen Organismen. Ein primäres Ziel dieser Arbeit ist eine umfassende Methodik und erläutern den gedanklichen Prozess angewendet in der Analyse und den daraus resultierenden Pool der Kandidaten zu minimieren. Diese Techniken umfassen die Analyse auf Zelle Bindung mit Fluoreszenz-aktivierte Zelle sortieren (FACS), um Affinität und Spezifität bei der Sortierung und beim Vergleich der einzelner Kandidaten zu beurteilen und die Analyse der Peptid-Sequenzen, um Trends zu erkennen und Konsensus-Sequenzen für das Verständnis und potenziell Verbesserung der Affinität zu und Spezifität für das Ziel von Interesse.

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