हम रिपोर्टर एंजाइम प्रतिदीप्ति (रेफरी) का उपयोग माइकोबैक्टीरियम तपेदिक (एम. तपेदिक) से संक्रमित चूहों के ऑप्टिकल इमेजिंग का वर्णन । इस प्रोटोकॉल रोगजनन, चिकित्सकीय और वैक्सीन अनुसंधान के लिए पूर्व नैदानिक पशु मॉडलों में एम. तपेदिक के संवेदनशील और विशिष्ट पता लगाने की सुविधा ।
रिपोर्टर एंजाइम प्रतिदीप्ति (REF) प्रतिदीप्ति या bioluminescence द्वारा इमेजिंग या पता लगाने के लिए ब्याज की लक्ष्य जीवों में मौजूद एंजाइमों के लिए विशिष्ट हैं कि सब्सट्रेट का उपयोग करता है. हम BlaC, एक एंजाइम सभी एम. तपेदिक उपभेदों द्वारा constitutively व्यक्त का उपयोग । रेफरी संक्रमित चूहों के फेफड़ों में बैक्टीरिया की तेजी से ठहराव की अनुमति देता है । चूहों के एक ही समूह कई समय बिंदुओं पर imaged किया जा सकता है, बहुत लागत को कम करने, बैक्टीरिया और अधिक तेजी से गणना, मेजबान में उपंयास टिप्पणियों-रोगज़नक़ बातचीत की अनुमति है, और बढ़ती सांख्यिकीय शक्ति, के बाद से अधिक जानवरों के समूह के प्रति आसानी से बनाए रखा है . रेफरी अत्यंत BlaC एंजाइमी रिपोर्टर और कस्टम flourescence अनुनाद ऊर्जा स्थानांतरण (झल्लाहट) या fluorogenic इस्तेमाल किया सब्सट्रेट के कारण विशिष्ट के उत्प्रेरक प्रकृति के कारण संवेदनशील है । रेफरी रिकॉमबिनेंट उपभेदों की आवश्यकता नहीं है, सामांय मेजबान-रोगज़नक़ बातचीत सुनिश्चित करने । हम ८०० एनएम में अधिक से अधिक उत्सर्जन के साथ एक झल्लाहट सब्सट्रेट का उपयोग कर एम. तपेदिक संक्रमण के इमेजिंग का वर्णन । सब्सट्रेट के तरंग दैर्ध्य संवेदनशील स्तनधारियों में गहरी ऊतक इमेजिंग की अनुमति देता है । हम M. तपेदिक, चूहों के संज्ञाहरण, रेफरी सब्सट्रेट के प्रशासन, और ऑप्टिकल इमेजिंग के साथ चूहों के एयरोसोल संक्रमण की रूपरेखा होगी । इस विधि का मूल्यांकन करने के लिए सफलतापूर्वक लागू किया गया है-रोगज़नक़ बातचीत और एंटीबायोटिक दवाओं की प्रभावकारिता एम. तपेदिकलक्ष्यीकरण ।
एम. क्षयरोग की धीमी वृद्धि दर तपेदिक1,2,3के तेजी से निदान में एक प्रमुख अंधी गली है । जबकि संस्कृति आधारित निदान सप्ताह के परिणाम का उत्पादन करने के लिए लेता है, एसिड-तेजी धब्बा4 बच्चों में नैदानिक सीमाएं हैं5 और रोगियों सह मानव इम्यूनो वायरस6,7के साथ संक्रमित. ऑप्टिकल इमेजिंग प्रौद्योगिकियों को हाल ही में तपेदिक8,9के लिए पारंपरिक नैदानिक तरीकों के लिए एक विकल्प के रूप में मांयता प्राप्त किया गया है । प्रतिदीप्ति और bioluminescence ऑप्टिकली छवि के लिए इस्तेमाल किया जा सकता है एम वास्तविक समय में जीवित पशुओं में तपेदिक 10,11,12,13,14, 15,16,17,18,19. ऑप्टिकल इमेजिंग एम. तपेदिक20,21,22के साथ एक संक्रमण के एक तेजी से और विशिष्ट आकलन का लाभ है ।
हम रेफरी का उपयोग लाइव चूहों में एम. तपेदिक की ऑप्टिकल इमेजिंग के लिए विवरण रूपरेखा । इस विधि बहुत विशिष्ट है और संवेदनशील23,24 और, अंय ऑप्टिकल तरीकों के समान, तपेदिक (टीबी) इमेजिंग25, गणना टोमोग्राफी सहित (सीटी)26, चुंबकीय के अंय तरीकों की तुलना में कम खर्चीला है अनुनाद इमेजिंग (एमआरआई)27, और f-fluorodeoxyglucose पोजीट्रान उत्सर्जन टोमोग्राफी/सीटी (एफ FDG पीईटी/सीटी)28। रेफरी कस्टम फ्लोरोसेंट या bioluminescent सब्सट्रेट का उपयोग करता है कि एक जीवाणु एंजाइम द्वारा दरार पर, एक फ्लोरोसेंट उत्पाद8,29का उत्पादन । इसलिए, यह एक रिकॉमबिनेंट माइक्रोबैक्टीरियल रिपोर्टर तनाव30,31की आवश्यकता नहीं के लाभ है । झल्लाहट सब्सट्रेट वर्णित एक fluorochrome और एक β-लस्टम अंगूठी है कि BlaC द्वारा hydrolyzed (β-lactamase) द्वारा जुड़ा एक शमन, स्वाभाविक रूप से तपेदिक द्वारा व्यक्त constitutively-परिसर माइकोबैक्टीरियम8के शामिल है, ३२. बैक्टीरिया सीधे रेफरी उत्प्रेरक गतिविधि है कि परिमाण के कई आदेशों और एम. तपेदिकके प्रति संवेदनशील का पता लगाने के प्रवर्धन की अनुमति देता है के कारण संकेत उत्पंन करते हैं ।
इस अध्ययन में इस्तेमाल किया रेफरी सब्सट्रेट रहते जानवरों में उत्कृष्ट ऊतक पैठ है और अपनी लंबी तरंग दैर्ध्य के कारण कम पृष्ठभूमि. के साथ इस लंबी तरंग दैर्ध्य सब्सट्रेट यह के लिए पता लगाने की एक दहलीज को प्राप्त करने के लिए संभव है लगभग १०० कॉलोनी बनाने इकाइयों (CFU) इन विट्रो में और < 1000 CFU vivo में चूहों के फेफड़ों में (पूरे पशु)8, ३३. रेफरी थूक के लिए एक नैदानिक उपकरण के रूप में इस्तेमाल किया जा सकता है, नैदानिक सामग्री और भी सीधे माइक्रो इंडोस्कोपिक सिस्टम के साथ रोगियों में16,३२,३३,३४ कारण अपनी उच्च संवेदनशीलता और विशिष्टता । रेफरी किसी भी तपेदिक नैदानिक तनाव को लागू किया जा सकता है, क्योंकि यह एक स्वाभाविक रूप से उत्पादित बैक्टीरियल एंजाइम, BlaC का उपयोग करता है, सभी उपभेदों में मौजूद पता लगाने के लिए । इन विशेषताओं रेफरी इमेजिंग पूर्व में एक मूल्यवान उपकरण नैदानिक तपेदिक अनुसंधान सामांय में चिकित्सीय और वैक्सीन मूल्यांकन की सुविधा के रूप में के रूप में अच्छी तरह से रोगजनन का विश्लेषण करना है, लेकिन यह भी अंततः तपेदिक में निदान के लिए लागू किया जा सकता है मरीज.
पशु अध्ययन दिशानिर्देश और विनियमों के अनुसार संस्थागत पशु देखभाल और टेक्सास के एक और एम विश्वविद्यालय के उपयोग समिति द्वारा निर्धारित किया गया । अपने संस्थान में किसी एक जोखिम सुरक्षा अधिकारी या समिति से समीक्षा और अनुमोदन की आवश्यकता हो सकती है ।
चेतावनी: सभी प्रक्रियाओं BSL3 रोकथाम की आवश्यकता होती है । कर्मियों को हर समय व्यक्तिगत सुरक्षात्मक उपकरण पहनना जरूरी होता है । सभी जोड़तोड़ के अंदर किया जाता है-सुरक्षा कैबिनेट (बीएससी) और सभी sharps sharps कंटेनरों में निपटारा कर रहे हैं । काम सतहों और बीएससी काम शुरू करने और काम के बाद से पहले buffered phenol और ७०% इथेनॉल के साथ साफ कर रहे हैं । प्रक्रियाओं आम तौर पर माइकोबैक्टीरियम तपेदिकके साथ सुरक्षा 3 स्तर पर किया जाएगा, लेकिन चित्रण और फिल्मांकन प्रयोजनों के लिए, लेखकों कम विषमय बैक्टीरिया के साथ सुरक्षा स्तर 2 पर इन प्रक्रियाओं का प्रदर्शन ।
1. उपभेदों और संस्कृति की स्थिति
नोट: एम. क्षयरोग तनाव CDC1551 का प्रयोग इस अध्ययन में किया जाता है, लेकिन किसी भी एम. तपेदिक तनाव का उपयोग इसी तरीके से किया जा सकता है.
2. एक मैडिसन चैंबर का उपयोग कर चूहों के एयरोसोल संक्रमण
3. पशु संज्ञाहरण
4. रिपोर्टर एंजाइम प्रतिदीप्ति (रेफरी) इमेजिंग
5. रेफरी इमेजिंग का विश्लेषण
6. CFU द्वारा जीवाणुओं का ठहराव
के साथ संक्रमित चूहों के रेफरी इमेजिंग एम. तपेदिक संक्रमित नियंत्रण माउस के साथ साथ चित्रा 1एमें दिखाए जाते हैं । संक्रमित चूहों एक महत्वपूर्ण उत्पादन (पी = ०.००५७) फेफड़ों से अधिक प्रतिदीप्ति संकेत 6 सप्ताह के बाद में संक्रमण सब्सट्रेट प्रशासन पर नियंत्रण की तुलना में. एक विशिष्ट समय पाठ्यक्रम के खिलाफ चिकित्सीय प्रभावकारिता का अध्ययन करने के लिए एम. तपेदिक रेफरी का उपयोग कर इमेजिंग हो सकता है सप्ताह में 1, 2, 4, 6, 15, 24 के बाद संक्रमण । प्रतिदीप्ति तीव्रता फेफड़े के ऊतकों (चित्रा 1बी) के लिए महामारी-रोशनी का उपयोग कर quantified है । 2 सप्ताह से लगातार बढ़ती संकेत संक्रमित चूहों के फेफड़ों में 6 सप्ताह के लिए पता चलता है कि रेफरी सफलतापूर्वक vivo में एम. तपेदिकका पता लगाने में सक्षम है । एक बाद में समय बिंदु पर नियंत्रण चूहों की पृष्ठभूमि संकेत में एक बूंद (चित्रा 1बी) के शरीर में वृद्धि के लिए जिंमेदार ठहराया जा सकता है और चूहों की मात्रा में 6 सप्ताह की अवधि से अधिक इस प्रकार उत्तेजना तरंग दैर्ध्य पैठ को कम करने । M. तपेदिक से संक्रमित चूहों में प्रतिदीप्ति स्रोतों के 3d फ्लिट पुनर्निर्माण चित्रा 2एमें प्रतिनिधित्व किया है । छवि दृश्यों एकाधिक ट्रांस में प्राप्त कर रहे है-दीप्ति अंक माउस में एक ही उत्तेजना और उत्सर्जन फिल्टर की श्रृंखला का उपयोग कर । ये छवि दृश्यों तो पशु विषय के भीतर फ्लोरोसेंट स्रोत वितरण के लिए 3 डी फ्लिट पुनर्निर्माण के लिए इस्तेमाल कर रहे हैं । चित्र 2 A-D फेफड़ों के अंग पंजीकरण के साथ माउस टोमोग्राफी के विभिंन दिशाओं (राज्याभिषेक, sagittal और transaxial) को दर्शाता है । पुनर्निर्माण की गुणवत्ता की जांच के लिए NTF दक्षता नक्शे चित्रा 2ईमें प्रतिनिधित्व कर रहे हैं । NTF तटस्थ घनत्व फिल्टर के साथ कब्जा कर लिया एक अतिरिक्त छवि के माध्यम से ट्रांस विदीप्ति छवियों से पृष्ठभूमि प्रकाश रिसाव को घटाकर अनुमति देता है । विशिष्ट उत्तेजना फ़िल्टर के साथ लिया छवि (चित्रा 2ई मापा) संचरण छवि के लिए सामान्यीकृत है एक ही उत्सर्जन फिल्टर और एक खुला उत्तेजना फिल्टर (चित्रा 2ई नकली) के साथ मापा देने के लिए सब्सट्रेट अकेले द्वारा उत्पादित संकेत. दोनों क्षैतिज (चित्रा 2एफ) और ऊर्ध्वाधर (चित्रा 2जी) प्रोफाइल में लगभग 0% प्रतिशत त्रुटि (चित्रा 2ई-% त्रुटि) के साथ समान मापा और नकली NTF दक्षता प्रोफ़ाइल कम कलाकृतियों और बेहतर संकेत स्थानीयकरण और संवेदनशीलता के साथ एक अच्छी गुणवत्ता 3 डी पुनर्निर्माण का सबूत प्रदान करता है ।
चित्र 1 . रेफरी के साथ एम. तपेदिक की इमेजिंग । (एक) vivo इमेजिंग में चूहों के संक्रमित और M. तपेदिक से संक्रमित 2, 4, और 6 सप्ताह के बाद संक्रमण । रंग बार कम (पीले) से उच्च (लाल) के लिए प्रति सेकंड प्रति सेमी फोटॉनों में फ्लोरोसेंट संकेत की तीव्रता का प्रतिनिधित्व करता है । (ख) एम. क्षयरोगसे संक्रमित चूहों से प्रतिदीप्ति तीव्रता का ठहराव. दोनों नियंत्रण के लिए प्रतिदीप्ति मूल्यों (काला) और संक्रमित (लाल) प्रत्येक समय बिंदु के लिए मानक त्रुटि के साथ प्रतिनिधित्व कर रहे हैं । परिणामों का महत्व छात्रों द्वारा निर्धारित किया गया था t-परीक्षण, < 0.05 के p मानों को महत्वपूर्ण माना गया था । कृपया यहां क्लिक करें इस आंकड़े का एक बड़ा संस्करण को देखने के लिए ।
चित्र 2 . 3 डी फ्लिट चूहों में प्रतिदीप्ति स्रोतों के पुनर्निर्माण से संक्रमित एम. क्षयरोग. माउस टोमोग्राफी अलग दिशाओं में प्रतिनिधित्व किया; अ) राज्याभिषेक, ब) sagittal, व C) transaxial D) लंग अंग नोंदणी. ब्याज की 3 डी क्षेत्र (रॉय) स्रोत माप के लिए फेफड़ों में एक लाल घन के रूप में प्रतिनिधित्व किया है । (ङ) NTF की दक्षता नक्शे मापा और पुनर्निर्माण की गुणवत्ता की जाँच के लिए नकली. मापा और नकली NTF दक्षता प्रोफ़ाइल की तुलना में, 3 डी पुनर्निर्माण की अच्छी गुणवत्ता प्रदान (समान मापा और नकली NTF दक्षता) था । F) क्षैतिज और छ) ऊर्ध्वाधर संकेत प्रोफाइल मापा (नीला) और नकली (लाल) NTF क्षमता वक्र का प्रतिनिधित्व । क्षैतिज और अनुलंब लाल पट्टियां स्रोत स्थिति का संकेत देती हैं । रंग बार कम (नीले) से उच्च (लाल) के लिए प्रति सेकंड प्रति सेमी फोटॉनों में फ्लोरोसेंट संकेत की तीव्रता का प्रतिनिधित्व करता है । कृपया यहां क्लिक करें इस आंकड़े का एक बड़ा संस्करण को देखने के लिए ।
जब इमेजिंग तकनीकों, जैसे REF का उपयोग करते हैं, तो महत्वपूर्ण रणनीतियाँ जो मजबूत और संगत डेटा के उत्पादन की अनुमति है । ऑप्टिकल इमेजिंग ऊतकों जो प्रवेश की गहराई को प्रभावित कर सकते में बिखरे हुए प्रकाश पैदा करता है, क्योंकि यह सभी दिशाओं में उत्सर्जित प्रकाश को पकड़ने के लिए मुश्किल है । एक के पास बुनियादी का प्रयोग करें-लाल fluorophore (NIR) सब्सट्रेट रेफरी इमेजिंग के लिए ७०० के Querange में एक उत्तेजना और उत्सर्जन तरंग दैर्ध्य होने-९०० एनएम स्तनधारी ऊतकों द्वारा फ्लोरोसेंट संकेत के ंयूनतम अवशोषण की सुविधा । कस्टम डिजाइन सब्सट्रेट एक NIR fluorophore जोड़ने के द्वारा निर्माण किया गया था, एक शमन करने के लिए IRDye 800Cw, IRDye QC-1, एक लस्टम की अनुमति अंगूठी द्वारा प्रतिदीप्ति अनुनाद ऊर्जा स्थानांतरण आधारित शमन. IRDye उत्कृष्ट ऊतक प्रवेश और प्रकाश बिखरने विशेषताओं है और स्तनधारियों पर कोई स्पष्ट हानिकारक प्रभाव नहीं है३६, 24 ज. प्रतिदीप्ति संकेत द्वारा रक्त और अंगों से साफ किया जा रहा है के बाद 4 ज शुरुआत काफी बढ़ जाती है सब्सट्रेट प्रशासन, अधिक से अधिक स्तर तक पहुँचने 6 ज प्रशासन के बाद.
बैक्टीरियल संक्रामक खुराक, संक्रामक खुराक और सब्सट्रेट के प्रशासन की विधा के रूप में अच्छी तरह से समय के रूप में प्रायोगिक अध्ययन प्रदर्शन से इमेजिंग पोस्ट संक्रमण के अंक बड़े, जटिल, प्रयोगों पर तैयार करने से पहले मानकीकृत किया जाना चाहिए. पायलट अध्ययनों से काफी समय और लागत को कम कर सकते हैं, क्योंकि एक मानक प्रक्रिया कुंजी प्रयोग करने से पहले अनुकूलित किया जा सकता है क्योंकि जानवरों की एक बड़ी संख्या इमेजिंग । बैक्टीरियल भार अंगों में निर्धारित किया जाना चाहिए/पूरे शरीर इमेजिंग का उपयोग कर ट्रांस रोशनी और पूर्व vivo फेफड़े इमेजिंग महामारी-रोशनी का उपयोग करने के लिए संकेत के स्रोत को मांय करने और सहसंबंध की गुणवत्ता का निर्धारण के बाद ब्याज की बैक्टीरिया की संख्या के साथ8मौजूद. पायलट अध्ययन पता लगाने की दहलीज, तकनीक के गतिशील रेंज के रूप में के रूप में अच्छी तरह से इमेजिंग के लिए इष्टतम प्रयोगात्मक शर्तों के निर्धारण में अंतर्दृष्टि प्रदान करेगा ।
के रूप में अंय फ्लोरोसेंट और bioluminescent रणनीतियों की तुलना में रेफरी इमेजिंग का उपयोग करने के प्राथमिक लाभ अपनी उच्च संवेदनशीलता और छवि को प्राकृतिक M. तपेदिक उपभेदों की क्षमता है । रेफरी इमेजिंग उत्प्रेरक मजबूत एंजाइम BlaC है कि सभी एम. तपेदिक नैदानिक अलग और तपेदिक परिसर उपभेदों में संरक्षित है का इस्तेमाल करता है । रेफरी इमेजिंग के महान संवेदनशीलता मेजबान सेल द्वारा सट फ्लोरोसेंट उत्पाद की अवधारण के साथ संयोजन में BlaC के तेजी से उत्प्रेरक दर के कारण है । संकेत लगातार जब तक सब्सट्रेट संक्रमित कोशिकाओं और ऊतकों के भीतर सिग्नल के लगभग असीम निर्माण अप में जिसके परिणामस्वरूप उपलब्ध है के रूप में बढ़ जाती है । इमेजिंग के वैकल्पिक दृष्टिकोण की तुलना में रेफरी इमेजिंग की यह वृद्धि की संवेदनशीलता के रूप में एम. तपेदिक दोनों इन विट्रो में और vivo8,23,24में विशिष्ट पता लगाने की अनुमति देता है, 29.
रेफरी इमेजिंग आनुवंशिक किसी भी संक्रमण मॉडल के लिए अपने सीधे आवेदन को सक्षम करने के संशोधनों के बिना बैक्टीरियल पता लगाने के लिए इस्तेमाल किया जा सकता है, या तो प्रयोगशाला पशु8,३७ या मानव नैदानिक सामग्री29,३८ . रेफरी का पता लगाने और छवि रोगजनकों की एक विस्तृत सरणी के लिए इस्तेमाल किया जा सकता है३९,४०, के बाद से fluorogenic सब्सट्रेट कई एंजाइमी जैसे BlaC के अलावा अंय लक्ष्यों के लिए विकसित किया जा सकता है जैसे कि, kinases, ureases, और β-galactosidases । हालांकि, सावधान सोचा लक्ष्य को दिया जाना चाहिए ताकि यह सुनिश्चित करने के लिए इमेजिंग के लिए इष्टतम विशेषताओं को प्रदर्शित करता है । BlaC विशेषताओं है कि इस रणनीति के सफल आवेदन सुनिश्चित करेगा के लिए एक अच्छा मॉडल एंजाइम का प्रतिनिधित्व करता है । रेफरी इमेजिंग एक तत्काल पढ़ें-जीवाणु लोड फेफड़ों में संक्रमण के दौरान मौजूद है, जो बहुत तपेदिक रोगजनन के अध्ययन में प्रगति गति पर बाहर प्रदान करता है, बैक्टीरियल संख्या के निर्धारण के बाद से सामांय रूप से तीन से छह सप्ताह की आवश्यकता है, लेकिन यहां तक कि अधिक में तेजी से बढ़ रहे जीवों को यह दृष्टिकोण समय की एक बड़ी बात की बचत होगी । रेफरी भी क्षय रोग से भेदभाव कार्सिनोमा के लिए इस्तेमाल किया जा सकता है, रोगियों में गांठदार घावों के निदान में एक प्रमुख समस्या४१,४२। रेफरी एक उपंयास उपकरण के रूप में कार्य करता है के लिए अनुवाद तपेदिक इमेजिंग में तेजी लाने और भी मनुष्यों के लिए लागू किया जा सकता है, संभवतः चिकित्सीय परिणामों की तेजी से भविष्यवाणी की अनुमति ।
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Isoflurane | VETONE | 501027 | |
CNIR800 | Custom synthesized | ||
Fatal Plus solution | Vortech Pharmaceutical Ls, Ltd | ||
7H9 Middlebrook broth | BD | 271310 | |
OADC Middlebrook enrichment | BD | 212351 | |
Sporcidin | RE-1284F | ||
7H11 Middlebrook Agar | BD | 212203 | |
Madison Chamber | |||
IVIS Spectrum | Perkin Elmer | 124262 | |
XGI-8-gas Anesthesia System | Perkin Elmer | ||
Living Imaging software | Perkin Elmer | ||
Transparent nose cones | Perkin Elmer | ||
M. tuberculosis strain CDC1551 | ATCC | ||
Female BALB/C mice, 5-7 weeks | Jackson Laboratory |
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