Descriviamo l'imaging ottico dei topi infettati con la tubercolosi del micobatterio (M. tuberculosis) usando la fluorescenza di enzima reporter (REF). Questo protocollo facilita la rilevazione sensibile e specifica di M. tuberculosis in modelli animali preclinici per la ricerca di patogenesi, terapeutica e vaccino.
Fluorescenza di enzima reporter (REF) utilizza substrati specifici per enzimi presenti negli organismi bersaglio di interesse per formazione immagine o rilevazione di fluorescenza o bioluminescenza. Utilizziamo BlaC, un enzima espresso costitutivamente da tutti i ceppi di M. tuberculosis . REF permette rapida quantificazione dei batteri nei polmoni dei topi infettati. Lo stesso gruppo di topi possa essere imaged in molti punti di tempo, notevolmente riducendo i costi, l'enumerazione dei batteri più rapidamente, permettendo osservazioni romanzo nelle interazioni ospite-patogeno e aumentando il potere statistico, poiché più animali per gruppo sono facilmente mantenuti . REF è estremamente sensibile a causa della natura catalitica del reporter enzimatica BlaC e specifico a causa del trasferimento di energia di risonanza di fluorescenza personalizzato (FRET) o substrati fluorogenici utilizzati. REF non richiedono ceppi ricombinanti, garantendo interazioni ospite-patogeno normale. Descriviamo l'imaging dell'infezione di tubercolosi del M. usando un substrato FRET con emissione massima a 800 nm. La lunghezza d'onda del substrato permette imaging sensibile dei tessuti profondi nei mammiferi. Ci illustrerà l'infezione aerosol dei topi con M. tuberculosis, anestesia dei topi, l'amministrazione del substrato REF e imaging ottico. Questo metodo è stato applicato con successo alla valutazione di efficacia di antibiotici targeting per M. tuberculosise interazioni ospite-patogeno.
Il tasso di crescita lenta di M. tuberculosis è un ostacolo importante nella diagnosi rapida di tubercolosi1,2,3. Mentre la cultura basata diagnosi vogliono settimane per produrre risultati, vetrino ha limiti diagnostici4 bambini5 e pazienti co-infetti con virus dell'immunodeficienza umana6,7. Tecnologie di imaging ottiche sono stati recentemente riconosciute come un'alternativa ai tradizionali metodi diagnostici per la tubercolosi8,9. Fluorescenza e bioluminescenza può essere utilizzati per immagine otticamente M. tuberculosis in animali vivi in tempo reale10,11,12,13,14, 15,16,17,18,19. Imaging ottico ha il vantaggio di una valutazione rapida e specifica di un'infezione con la tubercolosi di M.20,21,22.
Delineiamo dettagli per imaging ottico di M. tuberculosis in topi dal vivo utilizzando REF. Questo metodo è molto sensibile e specifico23,24 e, simile ad altri metodi ottici, è meno costoso rispetto ad altri metodi di imaging25, compreso tomografia computata (CT)26, magnetica la tubercolosi (TB) resonance imaging (MRI)27e F-fluorodesossiglucosio tomografia a emissione di positroni/CT (F-FDG PET/CT)28. REF utilizza personalizzati substrati fluorescenti o bioluminescenti che al momento della scissione di un enzima batterico, producono un prodotto fluorescente8,29. Quindi, ha il vantaggio di non richiedere un reporter micobatterica ricombinante ceppo30,31. Il substrato FRET descritto è composto di un fluorocromo e un quencher collegati da un anello β-lattamico che viene idrolizzato dalla BlaC (β-lattamasi), naturalmente costitutivamente espresso da tubercolosi-complesso Mycobacterium8, 32. i batteri direttamente generano segnale a causa di attività catalitica REF che permette l'amplificazione di molti ordini di grandezza e rivelazione sensibile di M. tuberculosis.
Il substrato REF utilizzato in questo studio ha tessuto eccellente penetrazione negli animali vivi e ridotto sfondo a causa della sua lunghezza d'onda. Con questo substrato di lunghezza d'onda è possibile raggiungere una soglia di rilevazione per M. tuberculosis di quasi 100 Colonia formando unità (CFU) in vitro e < 1000 CFU nei polmoni dei topi in vivo (animale intero)8, 33. REF può essere utilizzato come strumento diagnostico per espettorato, materiali clinici ed anche direttamente in pazienti con micro sistemi endoscopici16,32,33,34 dovuto la sua alta sensibilità e specificità. REF può essere applicato a qualsiasi ceppo clinico di tubercolosi, perché utilizza un enzima batterico prodotto naturalmente, BlaC, per rilevazione presente in tutti i ceppi. Queste caratteristiche rendono REF imaging in generale uno strumento prezioso nella ricerca pre-clinica tubercolosi per facilitare terapeutico e valutazione del vaccino, nonché analisi della patogenesi, ma anche, in definitiva, possono essere applicate alla diagnosi di tubercolosi pazienti.
Gli studi sugli animali sono stati eseguiti in conformità con le linee guida e regolamenti stabiliti dall'istituzionale Animal Care e uso Comitato della Texas A & M University. Revisione e approvazione da un ufficiale di sicurezza biohazard o comitato presso il vostro Istituto può essere richiesti.
Attenzione: Tutte le procedure richiedono BSL3 contenimento. Il personale sono tenuto a indossare dispositivi di protezione individuale in ogni momento. Tutte le manipolazioni vengono eseguite all'interno il gabinetto di biosicurezza (BSC) e tutti i diesis sono smaltiti in contenitori. Superfici di lavoro e BSC sono puliti con tamponata etanolo fenolo e 70% prima di iniziare il lavoro e dopo il lavoro. Le procedure normalmente sarebbero stato fatto a livello di biosicurezza 3 con il Mycobacterium tuberculosis, ma per l'illustrazione e scopi delle riprese, gli autori dimostrano queste procedure a livello di biosicurezza 2 con batteri meno virulenti.
1. ceppi e condizioni della coltura
Nota: Ceppo di M. tuberculosis CDC1551 è utilizzato in questo studio, ma qualsiasi ceppo di M. tuberculosis può essere utilizzato nello stesso modo.
2. l'infezione aerosol dei topi utilizzando una camera di Madison
3. animale anestesia
4. imaging di fluorescenza (REF) enzima reporter
5. analisi di REF imaging
6. quantificazione dei batteri di CFU
REF imaging dei topi infettati con la tubercolosi di M. insieme a controllo non infetti del mouse sono mostrati in Figura 1A. I topi infetti ha prodotto una significativamente (P = 0,0057) segnale di fluorescenza maggiore dai polmoni alle post-infezione 6 settimane, rispetto al controllo sulla gestione di substrato. Un corso tipico di tempo per studiare l'efficacia terapeutica contro M. tuberculosis mediante REF potrebbe essere imaging in settimana 1, 2, 4, 6, 15, 24 post-infezione. L'intensità di fluorescenza è quantificato utilizzando epi-illuminazione per tessuti polmonari (Figura 1B). Il segnale costantemente crescente dalla settimana 2 alla settimana 6 nei polmoni dei topi infettati suggerisce che REF è stato in grado di rilevare M. tuberculosis in vivo. Un calo del segnale di fondo dei topi di controllo in un secondo tempo (Figura 1B) potrebbe essere attribuito all'aumento nel corpo massa e volume dei topi in un periodo di 6 settimane, riducendo in tal modo la penetrazione di lunghezza d'onda di eccitazione. Ricostruzione 3D di FLIT delle fonti di fluorescenza in topi infettati con M. tuberculosis è rappresentato in Figura 2A. Le sequenze di immagini vengono acquisite in più punti trans-illuminazione del mouse utilizzando la stessa eccitazione e la serie di filtri di emissione. Queste sequenze di immagini vengono quindi utilizzate per la ricostruzione 3D di fuga alla CHETICHELLA per distribuzione sorgente fluorescente all'interno del soggetto animale. Figura 2 A-D di seguito viene illustrato le diverse direzioni (coronali, sagittali e transaxial) di tomografia del mouse con la registrazione dell'organo polmone. Efficienza NTF mappe per controllare la qualità di ricostruzione sono rappresentati in Figura 2,E. NTF permette di sottrarre le perdite di luce di sfondo dalle immagini di trans-illuminazione attraverso un'immagine supplementare catturata con filtro a densità neutra. L'immagine presa con il filtro di eccitazione specifico (Figura 2E-misurato) è normalizzato all'immagine di trasmissione misurata con lo stesso filtro di emissione e un filtro di eccitazione aperta (Figura 2E simulato) per dare il segnale prodotto dal substrato da solo. Il simile misurato e simulato il profilo di efficienza NTF in sia orizzontale (Figura 2,F) e verticale (Figura 2G) profili con quasi 0% percentuale di errore (Figura 2E-% errore) fornisce la prova di una ricostruzione 3D di buona qualità con riduzione artefatti e localizzazione del segnale migliorata e sensibilità.
Figura 1 . Imaging di M. tuberculosis con rif. (A) in vivo imaging dei topi non infetti e infettati con la tubercolosi di M. a 2, 4 e 6 settimane post-infezione. La barra dei colori rappresenta l'intensità del segnale fluorescente in fotoni al secondo per cm2 da basso (giallo) a alta (rosso). (B) quantificazione dell'intensità di fluorescenza da topi infettati con M. tuberculosis. Valori di fluorescenza per entrambi controllo (nero) e infetto (rosso) è rappresentato insieme all'errore standard per ogni punto di tempo. Il significato dei risultati è stato determinato da studenti t-test, i valori di p del < 0,05 sono stati considerati significativi. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
Figura 2 . 3D FLIT ricostruzione delle sorgenti di fluorescenza in topi infettati con M. tuberculosis. Tomografia del mouse rappresentata in direzioni diverse; A) coronale, B) sagittale e C) transaxial con registrazione dell'organo D) del polmone. La regione di interesse (ROI) 3D è rappresentata come un cubo rosso nel polmone per misurazioni di origine. (E) efficienza NTF mappe di misurato e simulato per verificare la qualità di ricostruzione. Il profilo di efficienza misurato e simulato NTF è stato confrontato, providing di buona qualità di ricostruzione 3D (efficienza simile misurato e simulato NTF). Segnale verticale orizzontale F) e G) profili che rappresentano misurato (blu) e simulata la curva di efficienza NTF (rossa). Le barre orizzontali e verticali rosse indicano la posizione di origine. La barra dei colori rappresenta l'intensità del segnale fluorescente in fotoni al secondo per cm2 da basso (blu) a alta (rosso). Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
Quando si utilizza tecniche di imaging, quali REF, non ci sono strategie chiave che consentono la generazione di dati affidabili e coerenti. Imaging ottico produce luce diffusa nei tessuti che possono influenzare la profondità di penetrazione, dato che è difficile da catturare la luce emessa in tutte le direzioni. Uso di un fluoroforo infrarosso vicino (NIR) substrato per REF imaging avendo una lunghezza d'onda di eccitazione e di emissione in Querange di 700-900 nm facilita l'assorbimento minimo del segnale fluorescente da tessuti di mammiferi. Il substrato personalizzato progettato fu costruito collegando un fluoroforo NIR, IRDye 800Cw a un quencher, QC IRDye-1, da un anello di lattame permettendo tempra basati sul trasferimento di fluorescenza risonanza energia. IRDye ha tessuto eccellente penetrazione e le caratteristiche di dispersione della luce e non ha alcun effetto nocivo evidente su mammiferi36, viene eliminato dal sangue e organi da 24 h. fluorescenza segnale significativamente aumenta cominciano 4 h dopo amministrazione di substrato, raggiungendo maximal livelli 6 h dopo la somministrazione.
La dose infettiva batterica, modalità di somministrazione della dose infettante e il substrato così come tempo-punti di imaging post infezione eseguendo studi pilota dovrebbe essere standardizzata prima di intraprendere grandi e complessi, esperimenti. Studi pilota possono ridurre notevolmente i tempi e i costi quando un gran numero di animali di imaging poiché una procedura standard può essere ottimizzata prima di fare l'esperimento chiave. Batteriche carichi dovrebbero essere determinati in organi/tessuti di interesse seguendo imaging di tutto il corpo utilizzando trans-illuminazione ed ex vivo formazione immagine del polmone usando epi-illuminazione per convalidare l'origine del segnale e determinare la qualità di correlazione con numeri batterici presenti8. Studi pilota fornirà approfondimenti la soglia di rilevazione, gamma dinamica della tecnica nonché la determinazione delle condizioni sperimentali ottimali per l'imaging.
I vantaggi principali dell'utilizzo di REF imaging come rispetto ad altre strategie di fluorescente e bioluminescenti sono sua alta sensibilità e abilità all'immagine naturale M. tuberculosis ceppi. REF imaging utilizza l'enzima cataliticamente robusto BlaC che è conservata in tutti gli isolati clinici di M. tuberculosis e ceppi di tubercolosi-complesso. La grande sensibilità di REF imaging è a causa del rapido tasso catalitico di BlaC in combinazione con conservazione del prodotto fluorescente fenduto dalla cellula ospite. Continuamente il segnale aumenta fino a quando il substrato è disponibile con conseguente accumulo quasi illimitata del segnale all'interno delle cellule infettate e tessuti. Questa maggiore sensibilità di REF imaging come rispetto ad approcci alternativi di imaging permette di rilevazione specifica di M. tuberculosis entrambi in vitro e in vivo8,23,24, 29.
REF di imaging può essere utilizzato per il rilevamento di batterico senza modificazioni genetiche che permette la sua applicazione diretta a qualsiasi modello di infezione, di animali o laboratorio8,37 o materiali clinici umani29,38 . REF può essere utilizzato per rilevare e immagine una vasta gamma di agenti patogeni39,40, poiché substrati fluorogenici possono essere sviluppati per numerosi obiettivi enzimatici oltre a BlaC come proteasi, chinasi, ureases e β-galattosidasi. Tuttavia, attenzione dovrebbe pensare alla destinazione al fine di garantire Visualizza caratteristiche ottimali per l'imaging. BlaC rappresenta un enzima buon modello per caratteristiche che garantiranno la riuscita applicazione di questa strategia. REF imaging fornisce una lettura immediata sulla carica batterica presente nei polmoni durante le infezioni, che accelera notevolmente i progressi nello studio della patogenesi di tubercolosi, poiché la determinazione dei numeri batterici normalmente richiede tre-sei settimane, ma anche in più rapida crescita organismi questo approccio vi farà risparmiare moltissimo tempo. REF potrebbe anche essere utilizzato per discriminare carcinomi da tubercolosi, un problema chiave nella diagnosi delle lesioni nodulari in pazienti41,42. REF serve come un nuovo strumento per accelerare la formazione immagine traslazionale tubercolosi e può essere applicato anche agli esseri umani, consentendo potenzialmente rapido pronostico dei risultati terapeutici.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Isoflurane | VETONE | 501027 | |
CNIR800 | Custom synthesized | ||
Fatal Plus solution | Vortech Pharmaceutical Ls, Ltd | ||
7H9 Middlebrook broth | BD | 271310 | |
OADC Middlebrook enrichment | BD | 212351 | |
Sporcidin | RE-1284F | ||
7H11 Middlebrook Agar | BD | 212203 | |
Madison Chamber | |||
IVIS Spectrum | Perkin Elmer | 124262 | |
XGI-8-gas Anesthesia System | Perkin Elmer | ||
Living Imaging software | Perkin Elmer | ||
Transparent nose cones | Perkin Elmer | ||
M. tuberculosis strain CDC1551 | ATCC | ||
Female BALB/C mice, 5-7 weeks | Jackson Laboratory |
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