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Cancer Research

Digitalen Polymerase-Kettenreaktion-Assay für die genetische Variation bei einem sporadischen familiäre adenomatöse Polyposis Patienten mit dem Chip-in-Rohr-Format

Published: August 20th, 2018

DOI:

10.3791/58199

1Department of Tumor Pathology, Hamamatsu University School of Medicine

Die Quantitative Analyse der menschlichen genetischen Variation ist entscheidend für das Verständnis der molekularen Eigenschaften des schweren Erkrankungen leiden, wie z. B. Tumoren. Da digitale Polymerase-Kettenreaktion (PCR) die genaue Quantifizierung der DNA-Kopie Zahl Varianten ermöglichen, werden sie ein wesentliches Instrument zur Erkennung von seltenen genetischen Variationen, wie z.B. Medikamenten-resistenten Mutationen. Es wird erwartet, dass Molekulare Diagnostik mittels digitaler PCR (dPCR) in naher Zukunft in der klinischen Praxis verfügbar sind; so, wie man effizient dPCR mit menschlichen Erbgut durchzuführen ist ein heißes Thema. Hier stellen wir eine Methode zur Erkennung adenomatöse Polyposis coli (APC) somatische Mosaikbildung mit dPCR mit der Chip-in-Rohr-Format, das acht dPCR Reaktionen gleichzeitig durchgeführt werden kann. Beim Füllen und verschließen das Reaktionsgemisch auf den Chips ist Vorsicht geboten. Dieser Artikel veranschaulicht, wie die über- und Unterschätzung der positiven Partitionen zu vermeiden. Ausserdem stellen wir ein einfaches Verfahren zum Sammeln von dPCR Produkt von Partitionen auf die Chips, die dann verwendet werden können, um die spezifische Verstärkung zu bestätigen. Wir hoffen, dass dieser Bericht hilft die dPCR mit der Chip-in-Rohr-Methode in der genetischen Forschung zu fördern.

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