Micron skala Phenotyping teknikker av mais vaskulær pakker basert på X-ray Microcomputed tomografi

Er det nødvendig å kvantifisere nøyaktig anatomiske strukturer i mais materialer basert på høy gjennomstrømming bildet analyseteknikker. Her gir vi en prøve forberedelse protokoll for mais materialer (dvs., stamme, blad og rot) egnet for vanlige microcomputed tomografi (mikro-CT) skanning. Basert på CT oppløsning av mais stammen, bladene og roten, beskriver vi to protokoller for fenotypiske analyse av vaskulær pakker: (1) basert på CT bildet av mais stilk og blad, vi utviklet en bestemt bildet analyse pipeline for å automatisk trekke 31 og 33 fenotypiske trekk av vaskulær pakker; (2) basert på CT bildet serien av mais rot, vi satt opp en bilde behandling plan for den tredimensjonale (3D) segmenteringen av metaxylem fartøy, og utdraget todimensjonal (2D) og 3D fenotypiske egenskaper, for eksempel volum, arealet av metaxylem fartøy, osv. Sammenlignet med tradisjonell manuell måling av vaskulær bunter av mais materialer, forbedre de foreslåtte protokollene betydelig effektiviteten og nøyaktigheten av mikron skala fenotypiske kvantifisering.