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Chemistry

बड़े पैमाने पर शीर्ष नीचे प्रोटियोमिक् केशिका जोन का उपयोग कर ट्रो मिलकर जन स्पेक्ट्रोमेट्री

Published: October 24th, 2018

DOI:

10.3791/58644

1Department of Chemistry, Michigan State University, 2Department of BioHealth Informatics, Indiana University-Purdue University Indianapolis, 3Center for Computational Biology and Bioinformatics, Indiana University School of Medicine
* These authors contributed equally

केशिका जोन ट्रो-electrospray ionization-मिलकर मास स्पेक्ट्रोमेट्री (CZE-ईएसआई-ms/ms) ऊपर-नीचे प्रोटियोमिक् के लिए एक उपयोगी उपकरण के रूप में पहचाना गया है जो जटिल proteoforms में proteomes को विशेषता प्रदान करता है । हालांकि, CZE के आवेदन-एमएस/ms के लिए बड़े पैमाने पर ऊपर-नीचे प्रोटियोमिक् कम नमूना-लोडिंग क्षमता और CZE के संकीर्ण जुदाई खिड़की से बाधित किया गया है । यहां, एक प्रोटोकॉल एक microliter पैमाने पर नमूना-लोड हो रहा है वॉल्यूम और बड़े पैमाने पर ऊपर-नीचे प्रोटियोमिक् के लिए एक ९०-ंयूनतम जुदाई खिड़की के साथ CZE-ms/ms का उपयोग कर वर्णन किया गया है । CZE-ms/ms प्लेटफ़ॉर्म एक रेखीय polyacrylamide (LPA) पर आधारित है-अत्यंत कम electroosmotic प्रवाह के साथ लेपित पृथक्करण केशिका, प्रोटीन स्टैकिंग के लिए एक उच्च दक्षता के साथ एक गतिशील पीएच-जंक्शन आधारित ऑनलाइन नमूना एकाग्रता विधि, एक इलेक्ट्रो-काइनेटिक पंप अत्यंत उच्च संवेदनशीलता के साथ म्यान फ्लो CE-एमएस इंटरफेस, और उच्च जन संकल्प और स्कैन गति के साथ एक आयन जाल जन स्पेक्ट्रोमीटर. मंच सरल बरकरार प्रोटीन के नमूनों की उच्च संकल्प लक्षण वर्णन और विभिंन जटिल proteomes में proteoforms के बड़े पैमाने पर लक्षण वर्णन के लिए इस्तेमाल किया जा सकता है । एक उदाहरण के रूप में, एक मानक प्रोटीन मिश्रण का एक अत्यधिक कुशल जुदाई और कई मंच का उपयोग अशुद्धियों का एक अति संवेदनशील पता लगाने का प्रदर्शन किया है । एक अंय उदाहरण के रूप में, इस मंच पर ५०० proteoform और १९० प्रोटीन पहचान एक ई कोलाई proteome से एक एकल CZE में उत्पादन कर सकते है एमएस/

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