Inmunoprecipitación de cromatina del tejido adiposo marrón murino

Procesos más celulares son regulados por modulación transcripcional de programas gen específico. Dicha modulación se logra a través de la acción combinada de una amplia gama de factores de transcripción (TFs) y cofactores mediando la activación transcripcional o represión a través de cambios en la estructura de la cromatina. Inmunoprecipitación de cromatina (ChIP) es un método de biología molecular útiles para mapeo de modificaciones de las histonas y perfiles de transcripción factores/cofactores vinculante al ADN, proporcionando una instantánea de los cambios nucleares dinámicos que ocurren en diferentes procesos biológicos.

Para estudiar la regulación transcripcional en el tejido adiposo, muestras procedentes de cultivos en vitro de células de inmortalizaron o líneas de células primarias son favorecidas a menudo en los ensayos de ChIP debido a la abundancia de material de partida y reducción variabilidad biológica. Sin embargo, estos modelos representan una instantánea limitada del estado real de la cromatina en organismos vivos. Así, hay una necesidad crítica de protocolos optimizados realizar ChIP en muestras de tejido adiposo procedentes de modelos animales.

Aquí se describe un protocolo para eficiente ChIP-seq de modificaciones de las histonas y proteínas no histonas en el tejido adiposo marrón (BAT) aislado de un ratón. El protocolo está optimizado para la investigación de genoma localización de proteínas de interés y marcadores epigenéticos en el murciélago, que es un tejido morfológicamente y fisiológicamente distinto entre los depósitos de grasa.