نمذجة الاشكال ثلاثية الابعاد وتحليل هياكل المخ

Summary

نحن نقدم بروتوكول شبه تلقائي لتحليل الشكل علي هياكل الدماغ ، بما في ذلك تجزئه الصورة باستخدام البرمجيات المفتوحة ، والمزيد من تحليل الشكل المجموعة الحكيمة باستخدام حزمه النمذجة الألى. هنا ، ونحن نظهر كل خطوه من بروتوكول تحليل الشكل 3D مع تقسيم هيبوكامبال من الدماغ MR الصور.

Abstract

وقد استخدم تحليل الشكل الإحصائي لهياكل المخ للتحقيق في العلاقة بين التغييرات الهيكلية والعمليات المرضية. لقد قمنا بتطوير حزمه برامج لنمذجة الشكل دقيقه وقويه وتحليل المجموعة الحكيمة. هنا ، نقدم خط أنابيب لتحليل الشكل ، من النمذجة شكل 3D الفردية إلى تحليل شكل المجموعة الكمية. كما نقوم بوصف خطوات المعالجة المسبقة والتجزئة باستخدام حزم البرامج المفتوحة. هذا الدليل العملي من شانه ان يساعد الباحثين توفير الوقت والجهد في تحليل الشكل 3D علي هياكل الدماغ.

Introduction

وقد برز تحليل الشكل من هياكل الدماغ كاداه مفضله للتحقيق في التغييرات المورفولوجية في اطار العمليات المرضية, مثل امراض الأعصاب والشيخوخة¹. علي مدي السنوات العديدة الماضية ، تم إدخال العديد من الطرق في دراسات التصوير العصبي لكل من هذه الخطوات. ومع ذلك ، وعلي الرغم من التطورات الملحوظة في الميدان ، لا توجد أطر كثيره تنطبق علي الفور علي البحوث. في هذه المقالة ، نقوم بوصف كل خطوه من تحليل شكل هياكل الدماغ باستخدام أدوات النمذجة المخصصة للشكل وأداات تقسيم الصور المتاحة للعامة.

هنا ، ونحن نظهر اطار تحليل الشكل للهياكل الدماغ من خلال تحليل الشكل من اليسار واليمين وهيبوكامبي باستخدام مجموعه بيانات من الضوابط الكبار ومرضي مرض ....

Protocol

تم الحصول علي صور الدماغ MR وفقا للبروتوكول الذي وافق عليه مجلس المراجعة المؤسسية المحلية ولجنه الأخلاق.

ملاحظه: يمكن تحميل أدوات نمذجة الشكل والتحليل من مستودع NITRC: https://www.nitrc.org/projects/dtmframework/. يمكن تنفيذ برنامج واجهه المستخدم .......

Discussion

باختصار ، لقد وصفنا خط أنابيب البرمجيات لتحليل الشكل علي هياكل الدماغ بما في ذلك (1) MR تجزئه الصورة باستخدام أدوات مفتوحة (2) أعاده بناء الشكل الفردية باستخدام نموذج قالب تشوه ، و (3) الفرق الشكل الكمي قياس عبر المراسلات شكل متعديه مع نموذج قالب. يتم اجراء التحليل الإحصائي تحت تصحيح معدل الاكت.......

Materials

Name	Company	Catalog Number	Comments