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In This Article

  • Summary
  • Abstract
  • Introduction
  • Protocol
  • Representative Results
  • Discussion
  • Acknowledgements
  • Materials
  • References
  • Reprints and Permissions

Summary

हम मस्तिष्क संरचनाओं पर आकार विश्लेषण के लिए एक अर्ध-स्वचालित प्रोटोकॉल पेश करते हैं, जिसमें खुले सॉफ़्टवेयर का उपयोग करके छवि विभाजन और स्वचालित मॉडलिंग पैकेज का उपयोग करके आगे समूह-वार आकार विश्लेषण शामिल है। यहां, हम मस्तिष्क एमआर छवियों से हिप्पोकैम्पस विभाजन के साथ 3 डी आकार विश्लेषण प्रोटोकॉल के प्रत्येक चरण को प्रदर्शित करते हैं।

Abstract

मस्तिष्क संरचनाओं के सांख्यिकीय आकार विश्लेषण का उपयोग उनके संरचनात्मक परिवर्तनों और रोग प्रक्रियाओं के बीच सहयोग की जांच करने के लिए किया गया है। हमने सटीक और मजबूत आकार मॉडलिंग और समूहवार विश्लेषण के लिए एक सॉफ्टवेयर पैकेज विकसित किया है। यहां, हम व्यक्तिगत 3 डी आकार मॉडलिंग से मात्रात्मक समूह आकार विश्लेषण तक आकार विश्लेषण के लिए एक पाइपलाइन पेश करते हैं। हम खुले सॉफ्टवेयर पैकेजों का उपयोग करके प्री-प्रोसेसिंग और सेगमेंटेशन चरणों का भी वर्णन करते हैं। यह व्यावहारिक गाइड शोधकर्ताओं को मस्तिष्क संरचनाओं पर 3 डी आकार विश्लेषण में समय और प्रयास को बचाने में मदद करेगा।

Introduction

मस्तिष्क संरचनाओं का आकार विश्लेषण रोग प्रक्रियाओं के तहत उनके रूपात्मक परिवर्तनों की जांच करने के लिए पसंदीदा उपकरण के रूप में उभरा है, जैसे न्यूरोडीजेनेरेटिव रोग और उम्र बढ़ने1। विभिन्न कम्प्यूटेशनल विधियों को 1) चिकित्सा छवियों से लक्षित संरचनाओं की सीमाओं को सटीक रूप से चित्रित करने की आवश्यकता होती है, 2) 3 डी सतह जाल के रूप में लक्ष्य आकार का पुनर्निर्माण, 3) आकार पैरामीटरेशन या सतह पंजीकरण के माध्यम से व्यक्तिगत आकार मॉडलों में अंतर-विषयों के पत्राचार का निर्माण करें, और 4) मात्रात्मक व्यक्तियों या समूहों के बीच क्षेत्रीय आकार के मतभेदों का आकलन करें। पिछले कई वर्षों में, इनमें से प्रत्येक चरण के लिए न्यूरोइमेजिंग अध्ययन में कई तरीके शुर....

Protocol

स्थानीय संस्थागत समीक्षा बोर्ड और आचार समिति द्वारा अनुमोदित प्रोटोकॉल के अनुसार ब्रेन एमआर छवियों का अधिग्रहण किया गया था ।

नोट: आकार मॉडलिंग और विश्लेषण के लिए उपकरण एनआईटीआरसी भं.......

Representative Results

यहां वर्णित आकृति मॉडलिंग प्रक्रिया में6,8,10 और अल्जाइमर रोग5,9पर विभिन्न न्यूरोइमेजिंग अध्ययनों के लिए नियोजित किया गया है । विशेष.......

Discussion

संक्षेप में, हमने मस्तिष्क संरचनाओं पर आकार विश्लेषण के लिए सॉफ्टवेयर पाइपलाइन का वर्णन किया है जिसमें (1) एमआर छवि विभाजन एक विकृत टेम्पलेट मॉडल का उपयोग करके खुले उपकरण (2) व्यक्तिगत आकार पुनर्निर्माण.......

Acknowledgements

इस काम को नेशनल रिसर्च फाउंडेशन ऑफ कोरिया (जेपी को पीआई के रूप में) ने फंड दिया था । जेके को क्यूंगपूक नेशनल यूनिवर्सिटी रिसर्च फंड द्वारा वित्त पोषित किया जाता है; और MCVH पंक्ति Fogo चैरिटेबल ट्रस्ट और एडिनबर्ग के रॉयल सोसायटी द्वारा वित्त पोषित है । हिप्पोकैम्पस विभाजन को ब्रिटेन के एडिनबर्ग के सेंटर फॉर क्लीनिकल ब्रेन साइंसेज में डॉ करेन फर्गगुसन द्वारा लिखे गए इन-हाउस दिशानिर्देशों से अनुकूलित किया गया था ।

....

Materials

NameCompanyCatalog NumberComments

References

  1. Costafreda, S. G., et al. Automated hippocampal shape analysis predicts the onset of dementia in mild cognitive impairment. NeuroImage. 56 (1), 212-219 (2011).
  2. Platero, C., Lin, L., Tobar, M. C.

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