Beyin Yapılarının Üç Boyutlu Şekil Modellemesi ve Analizi

Summary

Açık yazılım kullanarak görüntü bölümlemesi ve otomatik bir modelleme paketi kullanarak daha fazla grup-bilge şekil analizi de dahil olmak üzere beyin yapıları üzerinde şekil analizi için yarı otomatik bir protokol sıyoruz. Burada, beyin MR görüntülerinden hipokampal segmentasyon ile 3D şekil analizi protokolünün her adımını gösteriyoruz.

Abstract

Beyin yapılarının istatistiksel şekil analizi yapısal değişimleri ile patolojik süreçler arasındaki ilişkiyi araştırmak için kullanılmıştır. Doğru ve sağlam şekil modelleme ve grup analizi için bir yazılım paketi geliştirdik. Burada, tek tek 3B şekil modellemeden nicel grup şekil analizine kadar şekil analizi için bir boru hattı sıyoruz. Ayrıca, açık yazılım paketlerini kullanarak ön işleme ve segmentasyon adımlarını da açıklarız. Bu pratik kılavuz araştırmacılar beyin yapıları üzerinde 3D şekil analizi zaman ve çaba tasarrufu yardımcı olacaktır.

Introduction

Beyin yapılarının şekil analizi, nörodejeneratif hastalıklar ve yaşlanma gibi patolojik süreçler altında morfolojik değişimlerini araştırmak için tercih edilen bir araç olarak ortaya çıkmıştır^1. Çeşitli hesaplama yöntemleri 1) doğru tıbbi görüntülerden hedef yapıların sınırlarını belirlemesi için gereklidir, 2) 3D yüzey örgü şeklinde hedef şekli yeniden oluşturmak, 3) şekil parametreizasyonu veya yüzey kaydı yoluyla bireysel şekil modelleri arasında inter-konular yazışma oluşturmak, ve 4) nicel bireyler veya gruplar arasındaki bölgesel şekil farklılıkları değerlendirmek. Son birkaç yıl içinde, birçok yöntem bu adımların her biri için nörogörünt....

Protocol

Beyin MR görüntüleri yerel kurumsal inceleme kurulu ve etik komitesi tarafından onaylanan protokol uyarınca elde edildi.

NOT: Şekil modelleme ve analiz araçları NITRC deposundan indirilebilir: https://www.nitrc.org/projects/dtmframework/. GUI yazılımı (DTMModeling.exe) çıkarma dan sonra yürütülebilir.

Discussion

Özetle, (1) açık araçlar (2) deforme edilebilir bir şablon modeli kullanarak bireysel şekil rekonstrüksiyonu ve (3) nicel şekil farkı kullanarak MR görüntü segmentasyonu dahil olmak üzere beyin yapıları üzerinde şekil analizi için yazılım boru hattı açıklanmıştır şablon modeli ile geçişli şekil yazışmaları yoluyla ölçüm. Nöropatolojik süreçlerle ilişkili beyin yapılarının morfolojik değişikliklerinin önemini araştırmak için yanlış keşif oranı (FDR) düzeltmesi altında.......

Materials

Name	Company	Catalog Number	Comments