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Abstract

Neuroscience

न्यूरोलॉजिकल रोगों में लिपिडोमिक्स और ट्रांसक्रिप्टोमिक्स

Published: March 18th, 2022

DOI:

10.3791/59423

1Institute of Physiological Chemistry, University Medical Center of the Johannes Gutenberg University Mainz

Abstract

लिपिड मस्तिष्क के अपमान या न्यूरोलॉजिकल बीमारियों के लिए अनुकूल उत्तेजनाओं के लिए प्राथमिक इंटरफ़ेस के रूप में कार्य करते हैं और विभिन्न सिग्नलिंग या लिगैंड फ़ंक्शन के साथ लिपिड के संश्लेषण के लिए एक जलाशय हैं जो बीमारियों की शुरुआत और प्रगति को रेखांकित कर सकते हैं। अक्सर presymptomatic स्तर पर बदलते हुए, लिपिड दवा लक्ष्य और biomarkers का एक उभरता स्रोत हैं। कई न्यूरोलॉजिकल रोग न्यूरोइन्फ्लेमेशन, न्यूरोडीजेनेरेशन और न्यूरोनल उत्तेजना को आम हॉलमार्क के रूप में प्रदर्शित करते हैं, आंशिक रूप से विशिष्ट लिपिड सिग्नलिंग सिस्टम द्वारा संशोधित होते हैं। विभिन्न लिपिड के संश्लेषण की परस्पर निर्भरता और परस्पर संबंध एक बहुलिपिड, मल्टीएंजाइम और मल्टीरिसेप्टर विश्लेषण को संकेत देता है ताकि न्यूरोलॉजिकल संदर्भों की समानताएं और विशिष्टताओं को प्राप्त किया जा सके और रोग की शुरुआत और प्रगति के यांत्रिक पहलुओं को उजागर करने में तेजी लाई जा सके। अलग-अलग मस्तिष्क क्षेत्रों के लिए लिपिड भूमिकाओं की सदस्यता एक न्यूरोलॉजिकल बीमारी से जुड़े लिपिड आणविक फेनोटाइप और आकृति विज्ञान के निर्धारण को आगे बढ़ाती है।

यहां प्रस्तुत एक मॉड्यूलर प्रोटोकॉल है जो झिल्ली लिपिड और डाउनस्ट्रीम लिपिड संकेतों के विश्लेषण के लिए उपयुक्त है, साथ ही एंजाइमों और मध्यस्थों के एमआरएनए के साथ उनकी कार्यक्षमता अंतर्निहित है, जो असतत मस्तिष्क क्षेत्रों से निकाला गया है जो किसी विशेष न्यूरोलॉजिकल बीमारी और / या स्थिति के लिए प्रासंगिक हैं। सटीक तुलनात्मक लिपिडोमिक प्रोफाइलिंग सुनिश्चित करने के लिए, वर्कफ़्लो और ऑपरेटिंग मानदंडों को अनुकूलित और मानकीकृत किया गया था: i) मस्तिष्क का नमूना करण और ब्याज के क्षेत्रों का विच्छेदन, ii) कई लिपिड संकेतों और झिल्ली लिपिड का सह-निष्कर्षण, iii) दोहरी लिपिड / एमआरएनए निष्कर्षण, iv) तरल क्रोमैटोग्राफी मल्टीपल रिएक्शन मॉनिटरिंग (एलसी / एमआरएम) द्वारा परिमाणीकरण, और वी) मानक एमआरएनए प्रोफाइलिंग। यह वर्कफ़्लो कार्यात्मक रूप से असतत मस्तिष्क उप-क्षेत्रों (यानी मस्तिष्क छिद्रण द्वारा) के नमूने द्वारा प्राप्त कम ऊतक मात्रा के लिए उपयुक्त है, इस प्रकार ऊतक विषमता और / या पशु परिवर्तनशीलता के कारण बहु-आणविक विश्लेषण में पूर्वाग्रह को रोकता है। न्यूरोलॉजिकल बीमारियों के परिधीय परिणामों को प्रकट करने और न्यूरोलॉजिकल रोग राज्यों के ट्रांसलेशनल आणविक रीडआउट स्थापित करने के लिए, परिधीय अंग नमूनाकरण, प्रसंस्करण, और उनके बाद के लिपिडोमिक विश्लेषण, साथ ही प्लाज्मा लिपिडोमिक्स, का भी पीछा किया जाता है और वर्णित किया जाता है। प्रोटोकॉल एक तीव्र मिर्गी माउस मॉडल पर प्रदर्शित किया जाता है।

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