Иерархический и программируемый однопотный олигосахаридный синтез

В этой статье представлен общий экспериментальный протокол для программируемого синтеза олигосахарида одного горшка и показано, как использовать программное обеспечение Auto-CHO для генерации потенциальных синтетических решений. Программируемый один горшок олигосахарида синтез подход предназначен для расширения возможностей быстрого синтеза олигосахарида больших количествах с использованием тиогликозидных строительных блоков (BBLs) с соответствующим последовательным порядком относительных значений реактивности (RRVs). Auto-CHO является кросс-платформенным программным обеспечением с графическим пользовательским интерфейсом, который обеспечивает возможные синтетические решения для программируемого синтеза олигосахарида одного горшка путем поиска в библиотеке BBL (содержащей около 150 проверенных и точно предсказал RRV поддержки вектор регрессии. Алгоритм иерархического синтеза одного горшка реализован в Auto-CHO и использует фрагменты, генерируемые реакцией одного горшка, в качестве новых BBL. Кроме того, Auto-CHO позволяет пользователям давать обратную связь для виртуальных BBLs, чтобы сохранить ценные для дальнейшего использования. В этой работе показан одногоршоксинтез апогена 4 (SSEA-4), который является плюрипотентным маркером эмбриональных стволовых клеток человека.