Prospezione ceppi microbici per biorimediazione e lo sviluppo di probiotici per la ricerca e la conservazione dei metaorganismi

L'inquinamento colpisce tutti i biomi. Gli ambienti marini sono stati particolarmente colpiti, in particolare le barriere coralline, uno degli ecosistemi più sensibili sulla Terra. A livello globale, 4,5 miliardi di persone dipendono economicamente dal mare, dove la maggior parte del loro sostentamento è fornito dalle barriere coralline. I coralli sono di grande importanza e quindi la loro estinzione porta a conseguenze catastrofiche. Esistono diverse soluzioni possibili per rimediare agli inquinanti marini e alla contaminazione locale, tra cui la biorisanamento. La biorisanamento è la capacità degli organismi di degradare i contaminanti. L'approccio presenta diversi vantaggi, come la sostenibilità, il costo relativamente basso e il fatto che può essere applicato in diversi ecosistemi, causando impatti minimi sull'ambiente. Come ulteriore vantaggio, la manipolazione di microbiomi endogeni, compresi i microrganismi benefici putativi per i coralli (pBMC), può avere effetti probiotici per gli animali marini. In questo contesto, l'uso dei due approcci, la biorisanamento e l'inoculazione del pBMC combinati, potrebbe essere promettente. Questa strategia favorirebbe il degrado di specifici inquinanti che possono essere dannosi per i coralli e altri metaorganismi, aumentando al contempo la resistenza all'ospite e la resilienza per affrontare l'inquinamento e altre minacce. Questo metodo si concentra sulla selezione di pBMC per degradare due contaminanti: l'estrogeno sintetico 17a-ethinylestradiol (EE2) e petrolio greggio. Entrambi sono stati segnalati per avere un impatto negativo sugli animali marini, compresi i coralli, e gli esseri umani. Il protocollo descrive come isolare e testare i batteri in grado di degradare i contaminanti specifici, seguito da una descrizione di come rilevare alcune caratteristiche benefiche putative di questi microbi associati al loro ospite corallo. Le metodologie qui descritte sono relativamente economiche, facili da eseguire e altamente adattabili. Quasi qualsiasi tipo di composto bersaglio solubile può essere utilizzato al posto di EE2 e olio.