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我们描述了一种成像方法,用于测定由活细胞血浆膜中的配体结合诱导的mEGFP标记受体寡聚体的平均寡聚状态。该协议基于总内部反射荧光 (TIRF) 显微镜与数字和亮度 (N&B) 分析相结合。
尽管受体寡聚的重要性和普及性,但很少方法适用于检测聚类事件和测量聚类的程度。在这里,我们描述了一种成像方法,以确定活细胞膜中mEGFP标记受体同质复合物的平均寡聚状态。该协议基于总内部反射荧光 (TIRF) 显微镜与数字和亮度 (N&B) 分析相结合。N&B 是一种类似于荧光相关光谱 (FCS) 和光子计数直方图 (PCH) 的方法,该方法基于对荧光团荧光强度波动的统计分析,该分析在照明中扩散出来在观察时间内的体积。特别是,N&B是PCH的简化,以获得关于寡聚混合物中蛋白质平均数量的信息。强度波动幅度由荧光的分子亮度和照明体积内的平均荧光量来描述。因此,N&B只考虑振幅分布的第一个和第二个时刻,即平均强度和方差。这同时也是方法的强弱。由于只考虑了两个时刻,N&B无法确定混合物中未知寡聚物的摩尔部分,但它仅估计混合物的平均寡聚状态。然而,只需监测荧光强度的时间波动,即可应用于相对较小的时间序列(与其他瞬时方法相比),以逐像素为基础。它将每像素的有效时间缩短到几微秒,允许在秒到毫秒的时间内采集,这是快速寡头化动力学所必需的。最后,可以探索大细胞区域以及亚细胞隔间。
我们描述了一种总内部反射荧光数和亮度(TIRF-N&B)成像方法,用于确定活细胞血浆膜上受体分子的平均寡聚状态,旨在连接受体组件蛋白质的生物功能动力学(图1)。
在细胞外配体结合时,受体根据其构象、寡聚物、潜在的共受体和膜组成启动细胞内信号转导。尽管受体寡聚的重要性和普及性,在细胞信号1,2,3,4,5,6中被确认为关键事件,7、少数方法可以检测聚类事件,并实验性地测量聚类的程度8,9。共聚焦体积(x,y = 300 nm,z = 900 nm)不足以证明分子相互作用和化学测量,即使在通过图像恢复算法10进行优化后也是如此。蛋白质寡聚物的亚单位组成不能在纯粹的空间基础上解决,即使超分辨率的方法在x,y分辨率为20-70n....
1. 样品制备
图5和补充表1显示了同一培养皿中两个代表性的HeLa-mEGFP-FGFR1细胞的结果。在添加FGF2配体后,在0分钟(图5A,上图)和7分钟(图5A,底部)捕获两个细胞。
图5还显示了两个代表性的HeLa细胞的结果,?.......
N&B 在选择细胞模型和标签策略时需要采取若干预防措施。它只能应用于在图像捕获期间保持稳定粘附的活细胞。由于整个细胞刚性位移引起的额外波动,可以通过适当的图像恢复方法38来处理。然而,一般当细胞移动时,细胞膜也会变形,结构变形,产生较大的额外方差,对膜蛋白的分析造成严重限制。在这项工作中,荧光结构在HeLa细胞系中表达,因为构成FGFR1可以忽略不计。?.......
CNIC由Ciencia、创新与大学部和Pro CNIC基金会支持,是塞韦罗·奥乔亚卓越中心(SEV-2015-0505)。我们还得到欧洲区域发展基金(FEDER)"欧洲区域发展基金"的支持。UC 感谢意大利癌症协会、国际癌症研究协会(现称全球癌症研究)和意大利卫生部的支持。A.T. 感谢"伦巴第大区万达松银行"部分支持他与PV奖学金"Progetto专业+ 伊万诺贝奇"2011-2012年的工作。
....Name | Company | Catalog Number | Comments |
3-Colour Fast TIRF Leica AM TIRF MC inverted microscope, with smi-automatic TIRF alignment. The microscope is equipped with a diode 488 nm laser, a 100x1.46 oil TIRF objective, Ex/Em Bandpass filters at 490/20 and 525/50, temperature/CO2 incubator and Andor DU 8285 VP EMCCD camera. The microscope is operated by Leica LIF software. | Leica Microsystems, Wetzlar, Germany | ||
Albumin from Bovine Serum 98% minimun | Sigma-Aldrich, St. Louis, MI, USA | A7906-100G | |
DMEM without Phenol Red with 25 mM HEPES | GIBCO Thermo Fisher Scientific,Waltham, MA, USA | 21063029 | Used serum free for microscopy |
DMEM high-glucose GlutaMAX I | GIBCO Thermo Fisher Scientific,Waltham, MA, USA | 10566-016 | Used for complete medium |
Dulbecco's Phosphate Buffered Saline 10x (PBS) | Biowest, Nuaillé, France | X0515-500 | |
Emission splitting system Photometrics DV2 | TeledynePhotometrics, Tucson, AZ, USA | ||
Fetal Bovine Serum, qualified, Brazil | GIBCO Thermo Fisher Scientific,Waltham, MA, USA | 10270106 | 10% inactivated supplement for complete medium |
Glass bottom 35-mm sterile 1.5 dishes | MatTek, Ashland, MA, USA | P35G-0.170-14-C | uncoated, glass thickness 0.17 microns |
GraphPad Prism | GraphPad Software Inc., San Diego, CA, USA | ||
Human cervical carcinoma (HeLa), serum-free animal component (AC) cells | Millipore-Sigma ECACC, Darmstadt, Germany | CB_08011102 | |
iXonEM+ 897 EMCCD (back-illuminated) ANDOR camera controlled by ANDOR Solis software | Oxford Instruments, Andor TM Technology, Abingdon-on-Thames, UK | This camera, installed in an additional port of the microscope, is used for acquiring the N&B time series | |
Matlab Executable N&B routine | Unit of Microscopy and Dynamic Imaging, CNIC, Madrid, Spain | download at https://www.cnic.es/en/investigacion/2/1187/tecnologia | |
MatLab v.2018b | The MathWorks, Inc. Natick, MA, USA | download at https://www.mathworks.com/products/matlab.html | |
Penicillin:Streptomycin for tissue culture 100x | Biowhittaker Inc. Walkersville, MD, USA | LONZA 17-602E | supplement for medium at Penicillin/Streptomycin 100U/100µg. |
pN1-mEGFP-FGFR1 expression vector | Unit of Gynecological Oncology Research, European Institute of Oncology IRCCS, Milan, Italy | Zamai et al., 2019 | |
pN1-N-Gly-mEGFP-GPI expression vector | Unit of Microscopy and Dynamic Imaging, CNIC, Madrid, Spain | Hellriegel et al., 2011 | |
pN1-N-Gly-mEGFP-mEGFP-GPI expression vector | Unit of Microscopy and Dynamic Imaging, CNIC, Madrid, Spain | Hellriegel et al., 2011 | |
Recombinant FGF2 | PeproTech EC, Ltd., London, UK | Ligand solution: 20ng/mL of FGF2 in PBS supplemented with 0.01%BSA. | |
Sodium pyruvate GIBCO | ThermoFisher Scientific | 11360070 | 1mM supplement for medium |
TransIt-LT1 Transfection Reagent | MirusBio LLC, Madison, WI, USA | MIR 2300 | |
Trypsin-EDTA (0.25%), phenol red | GIBCO Thermo Fisher Scientific,Waltham, MA, USA | 25200056 | |
Type F Immersion liquid 10 mL | Leica Microsystems, Wetzlar, Germany | 11513 859 | |
UltraPure BSA (50 mg/mL) | ThermoFisher Scientific | AM2618 | 0.1% supplement for medium without phenol red used for transfections |
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