שימוש בתרמופורזה מיקרומטרית למדידת אינטראקציות בין חלבון לליפיד

היכולת לקבוע את הזיקה המחייבת של שומנים לחלבונים היא חלק חיוני בהבנת אינטראקציות חלבון-שומנים בסחר בממברנות, העברת אותות ושיפוץ ציטוסקיל. כלים קלאסיים למדידת אינטראקציות כאלה כוללים תהודה פלסמון פני השטח (SPR) וקלורימטריה איזותרמית טיטרציה (ITC). בעוד כלים רבי עוצמה, גישות אלה יש מכשולים. ITC דורש כמויות גדולות של חלבון מטוהר, כמו גם שומנים, אשר יכול להיות יקר וקשה לייצר. יתר על כן, ITC, כמו גם SPR הם זמן רב מאוד, אשר יכול להוסיף באופן משמעותי את העלות של ביצוע ניסויים אלה. דרך אחת לעקוף הגבלות אלה היא להשתמש בטכניקה החדשה יחסית של תרמופורזה מיקרומטרית (MST). MST הוא מהיר וחסכוני באמצעות כמויות קטנות של מדגם כדי להשיג עקומת רוויה עבור אירוע איגוד נתון. קיימים כעת שני סוגים של מערכות MST זמינים. סוג אחד של MST דורש תיוג עם פלואורופור בספקטרום הכחול או האדום. המערכת השנייה מסתמכת על הפלואורסצנטיות הפנימית של חומצות אמינו ארומטיות בטווח UV. שתי המערכות מזהות את תנועת המולקולות בתגובה לאינדוקציה מקומית של חום מלייזר אינפרא אדום. לכל גישה יש את היתרונות והחסרונות שלה. MST ללא תוויות יכול להשתמש בחלבונים מקומיים לא מתויגים; עם זאת, ניתוחים רבים, כולל תרופות, פלואורסצ'ה בטווח UV, אשר יכול להפריע לקביעה של ערכי KD מדויקים. לשם השוואה, MST שכותרתו מאפשר מגוון גדול יותר של אינטראקציות הניתנות למדידה של זוג המשתמשות בבדיקות המסומנות בפלואורסצנטיות המצורפות לליגנדים עם ספיגות מדידות בטווח הנראה לעין לעומת UV, מה שמגביל את הפוטנציאל להפרעה לאותות מניתוחים.