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Genetics

Identificazione del recettore della superficie cellulare utilizzando schermi genetici CRISPR/Cas9 su scala genomica

Published: June 6th, 2020

DOI:

10.3791/60803

1Cell Surface Signalling Laboratory, Wellcome Trust Sanger Institute, 2EMBL-EBI, Wellcome Genome Campus

Abstract

La comunicazione intercellulare mediata da interazioni dirette tra i recettori della superficie cellulare incorporati nella membrana è fondamentale per il normale sviluppo e funzionamento degli organismi multicellulari. Tuttavia, il rilevamento di queste interazioni rimane tecnicamente impegnativo. Questo manoscritto descrive un approccio sistematico di screening genetico CRISPR/Cas9 su scala genomica che rivela i percorsi cellulari necessari per eventi specifici di riconoscimento della superficie cellulare. Questo saggio utilizza proteine ricombinanti prodotte in un sistema di espressione proteica dei mammiferi come acconde di legame avido per identificare i partner di interazione in uno schermo genetico basato sulle cellule. Questo metodo può essere utilizzato per identificare i geni necessari per le interazioni della superficie cellulare rilevate dalle sonde di legame ricombinanti corrispondenti agli ectodomini dei recettori incorporati nella membrana. È importante sottolineare che, data la natura su scala del genoma di questo approccio, ha anche il vantaggio di identificare non solo il recettore diretto, ma anche i componenti cellulari necessari per la presentazione del recettore sulla superficie cellulare, fornendo così preziose informazioni sulla biologia del recettore.

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