蛋白质组学设施提交和后续数据分析的TMT样品制备

蛋白体技术是强有力的方法论，通过提供疾病、治疗或其他疾病对整个蛋白体的影响的全球视图，帮助我们理解生物系统中的行动机制。本报告为蛋白质样品的提取、定量、沉淀、消化、标记和后续数据分析提供了详细的协议。我们优化的TMT标签协议要求降低标签标签浓度，并实现一致可靠的数据。我们使用这种协议来评估各种小鼠组织（即心脏、骨骼肌和大脑）以及体外培养的细胞中的蛋白质表达特征。此外，我们还演示如何从生成的数据集中评估数千种蛋白质。