JoVE Logo
Faculty Resource Center

Sign In

Abstract

Behavior

Özellik Öğrenme Bacak Segmentasyon ve İzleme (FLLIT) kullanarak Serbestçe Hareket Eden Böceklerde Tam Otomatik Bacak Takibi

Published: April 23rd, 2020

DOI:

10.3791/61012

1Institute of Molecular and Cell Biology, Agency for Science, Technology and Research, 2Bioinformatics Institute, Agency for Science, Technology and Research, 3Department of Electrical and Computer Engineering, University of Alberta

Abstract

Drosophila modeli nörolojik fonksiyon çalışması ve nörodejenerasyon altında yatan moleküler ve hücresel mekanizmaları anlamak için paha biçilmez olmuştur. Manipülasyon ve nöronal alt kümelerin çalışma için sinek teknikleri giderek sofistike büyüdü iken, ortaya çıkan davranışsal fenotiplerin zenginliği benzer bir ayrıntıda yakalanmış değil. Mutantlar arasında karşılaştırma için ince sinek bacak hareketleri çalışma yapabilmek için otomatik olarak ölçmek ve yüksek hız ve hızlı bacak hareketleri ölçmek için yeteneği gerektirir. Bu nedenle, serbestçe yürüyen sineklerde otomatik bacak pençesi takibi, Özellik Öğrenme tabanlı Uzuv segmentasyonu ve takibi (FLLIT) için bir makine öğrenme algoritması geliştirdik. Çoğu derin öğrenme yönteminin aksine, FLLIT tam otomatiktir ve öğrenme algoritması yerleşik morfolojik parametreleri kullanarak, kullanıcı ek açıklama için gerek kalmadan kendi eğitim setleri oluşturur. Bu makalede, FLLIT kullanarak yürüyüş analizi yürütmek için derinlemesine bir protokol açıklanmaktadır. Bu kamera kurulumu, arena yapımı, video kayıt, bacak segmentasyon ve bacak pençe izleme prosedürleri ayrıntıları. Ayrıca, her video karesinde ham izlenmiş gövde ve bacak konumlarını, 20 yürüyüş parametrelerini, 5 çizimi ve izlenen videoyu içeren FLLIT tarafından üretilen verilere genel bir bakış sunar. FLLIT kullanımını göstermek için, spinocerebellar ataksi 3 bir sinek modeli nde ilgili hastalıklı yürüyüş parametrelerini ölçmek.

Explore More Videos

Davran

This article has been published

Video Coming Soon

JoVE Logo

Privacy

Terms of Use

Policies

Research

Education

ABOUT JoVE

Copyright © 2024 MyJoVE Corporation. All rights reserved