Стратегия биосенсорного анализа высокой пропускной способности и биоинформатики для глобальной проверки взаимодействий между наркотиками и белком

Рецепторы и ферментные белки являются важными биомолекулами, которые действуют как связывающие мишени для биологически активных малых молекул. Таким образом, быстрая и глобальная проверка лекарственно-белковых взаимодействий крайне желательна не только для понимания молекулярных механизмов, лежащих в основе терапевтической эффективности, но и для оценки характеристик препарата, таких как адсортация, распределение, обмен веществ, выделение и токсичность (ADMET) для клинического использования. Здесь мы представляем биосенсорную стратегию высокой пропускной способности для биопанирования коротких пептидов T7, которые легко отображаются на фаговом капсиде. Также показан последующий анализ аминокислотных последовательностей пептидов, содержащих короткие сегменты, как "сломанные реликвии", лекарственных обязательных участков с использованием программ биоинформатики в рецепторном лиганд-контакте (RELIC). Применяя этот метод к двум клинически одобренным препаратам, антиопухольцумный иринотекан и противофлю осельтамивир, подробный процесс сбора лекарственных пептидных последовательностей и выделения обязательных для наркотиков участков целевых белков объясняется в этой статье. Стратегия, описанная в этом, может быть применена для любых небольших молекул, представляющих интерес.