Imagerie en direct à haut débit des microcolonies pour mesurer l’hétérogénéité de la croissance et de l’expression des gènes

Des mesures précises de l’hétérogénéité entre les souches et à l’intérieur de la souche dans les taux de croissance microbienne sont essentielles pour comprendre les apports génétiques et environnementaux dans la tolérance au stress, la pathogénie et d’autres composantes clés de la condition physique. Ce manuscrit décrit un test au microscope qui suit environ 10⁵microcoloniesSaccharomyces cerevisiae par expérience. Après l’imagerie automatisée en accéléré de levure immobilisée dans une plaque multiwell, les taux de croissance de la microcolonie sont facilement analysés à l’aide d’un logiciel d’analyse d’image personnalisé. Pour chaque microcolonie, l’expression et la localisation des protéines fluorescentes et la survie du stress aigu peuvent également être surveillées. Cet essai permet une estimation précise des taux de croissance moyens des souches, ainsi qu’une mesure complète de l’hétérogénéité de la croissance, de l’expression des gènes et de la tolérance au stress au sein des populations clonales.