في النواة مرحبا C في خلايا دروسوفيلا

يتم تنظيم الجينوم في مجالات ربط طوبولوجية (TADs) محددة بحدود تعزل التفاعلات بين المجالات. وفي دروسوفيلا، لا تزال الآليات الكامنة وراء تكوين هذا المرض وحدوده قيد التحقيق. ساعد تطبيق طريقة Hi-C في النواة الموصوفة هنا على تشريح وظيفة مواقع الربط للبروتين المعماري (AP) عند حدود TAD التي تعزل جين Notch. يؤدي التعديل الوراثي لحدود النطاقات التي تسبب فقدان APs إلى دمج TAD ، والعيوب النسخية ، والتعديلات الطوبولوجية طويلة المدى. وقدمت هذه النتائج أدلة تثبت مساهمة العناصر الوراثية في تكوين حدود النطاق والتحكم في التعبير الجيني في دروسوفيلا. هنا، تم وصف طريقة Hi-C في النواة بالتفصيل، والتي توفر نقاط تفتيش مهمة لتقييم جودة التجربة جنبا إلى جنب مع البروتوكول. كما تظهر الأعداد المطلوبة من قراءات التسلسل وأزواج Hi-C الصالحة لتحليل التفاعلات الجينومية على نطاقات جينومية مختلفة. ويمكن أن يكون التحرير الجيني بوساطة CRISPR/Cas9 للعناصر التنظيمية والتنميط عالي الاستبانة للتفاعلات الجينية باستخدام هذا البروتوكول Hi-C في النواة مزيجا قويا للتحقيق في الوظيفة الهيكلية للعناصر الوراثية.