Abstract
Biochemistry
אסילציה שומנית, התוספת הקוולנטית של חומצות שומן רוויות למצעי חלבון, חשובה בוויסות מספר עצום של פונקציות תאיות בנוסף להשלכותיה בסרטן ובמחלות ניווניות. ההתפתחויות האחרונות בשיטות זיהוי אסילציה שומנית אפשרו זיהוי יעיל ולא מסוכן של חלבונים עתירי שומן, במיוחד באמצעות שימוש בכימיה של קליקים עם תיוג ביו-אורתוגונלי. עם זאת, זיהוי כימיה קליק יכול להיות מוגבל על ידי מסיסות לקויה והשפעות רעילות פוטנציאליות של הוספת חומצות שומן שרשרת ארוכה לתרבות התא. מתואר כאן היא גישת תיוג עם משלוח ממוטב באמצעות חומצות שומן saponified בשילוב עם BSA ללא חומצות שומן, כמו גם מדיה delipidated, אשר יכול לשפר את הזיהוי של חלבונים acylated שומן קשה לזהות. אפקט זה היה בולט ביותר עם אנלוגי אלקיניל-סטארט, 17-ODYA, אשר היה אנלוגי חומצת השומן הנפוצה ביותר בזיהוי כימיה קליק של חלבונים אציליים. שינוי זה ישפר את התאגדות התאים ויגביר את הרגישות לזיהוי חלבונים מצולק. בנוסף, גישה זו יכולה להיות מיושמת במגוון סוגי תאים בשילוב עם בדיקות אחרות כגון ניתוח מרדף דופק, תיוג איזוטופ יציב עם חומצות אמינו בתרבית התאים, ספקטרומטריית מסה עבור פרופיל כמותי של חלבונים אסילציה שומן.
ABOUT JoVE
Copyright © 2024 MyJoVE Corporation. All rights reserved