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Biochemistry

फैटी Acylated प्रोटीन का पता लगाने के लिए Alkynyl फैटी एसिड Analogs के अनुकूलित निगमन क्लिक रसायन विज्ञान का उपयोग कर

Published: April 9th, 2021

DOI:

10.3791/62107

1Department of Biology, University of Waterloo

Abstract

फैटी एसाइलेशन, प्रोटीन सब्सट्रेट के लिए संतृप्त फैटी एसिड के सहसंयोजक जोड़, कैंसर और न्यूरोडीजेनेरेटिव बीमारियों में इसके निहितार्थ के अलावा सेलुलर कार्यों के असंख्य को विनियमित करने में महत्वपूर्ण है। फैटी एसाइलेशन डिटेक्शन विधियों में हाल के विकास ने फैटी एसाइलेटेड प्रोटीन के कुशल और गैर-खतरनाक पता लगाने को सक्षम किया है, विशेष रूप से जैव-ऑर्थोगोनल लेबलिंग के साथ क्लिक रसायन विज्ञान के उपयोग के माध्यम से। हालांकि, क्लिक रसायन विज्ञान का पता लगाने को सेल संस्कृति में लंबी श्रृंखला फैटी एसिड जोड़ने के खराब घुलनशीलता और संभावित विषाक्त प्रभावों द्वारा सीमित किया जा सकता है। यहां वर्णित फैटी-एसिड मुक्त बीएसए के साथ संयोजन में सैपोनिफाइड फैटी एसिड का उपयोग करके अनुकूलित वितरण के साथ एक लेबलिंग दृष्टिकोण है, साथ ही साथ डिलिपिडेड मीडिया भी है, जो फैटी एसाइलेटेड प्रोटीन का पता लगाने के लिए कठिन का पता लगाने में सुधार कर सकता है। यह प्रभाव एल्काइनिल-स्टीयरेट एनालॉग, 17-ODYA के साथ सबसे अधिक स्पष्ट था, जो एसाइलेटेड प्रोटीन के क्लिक रसायन विज्ञान का पता लगाने में सबसे अधिक इस्तेमाल किया जाने वाला फैटी एसिड एनालॉग रहा है। यह संशोधन सेलुलर निगमन में सुधार करेगा और एसाइलेटेड प्रोटीन का पता लगाने के लिए संवेदनशीलता में वृद्धि करेगा। इसके अलावा, इस दृष्टिकोण को विभिन्न प्रकार के सेल प्रकारों में लागू किया जा सकता है और अन्य assays जैसे पल्स-चेस विश्लेषण, सेल संस्कृति में अमीनो एसिड के साथ स्थिर आइसोटोप लेबलिंग, और फैटी एसाइलेटेड प्रोटीन की मात्रात्मक प्रोफाइलिंग के लिए मास स्पेक्ट्रोमेट्री के साथ संयुक्त किया जा सकता है।

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