JoVE Logo
Faculty Resource Center

Sign In

Abstract

Biochemistry

이동식 XY 단계가 있는 플랫폼 인큐베이터: 단백질의 세포 내 빠른 광화학 산화 를 구현하기위한 새로운 플랫폼

Published: May 17th, 2021

DOI:

10.3791/62153

1Department of Pharmaceutical Sciences, University of Maryland Baltimore, 2Technology Research Center, University of Maryland Baltimore County, 3Department of Biochemistry and Molecular Biology, University of Massachusetts

질량 분광법(MS)과 결합된 단백질(FPOP)의 빠른 광화학 적 산화는 용매 접근성의 함수로서 단백질 상호 작용, 구조 및 단백질 형성 역학을 심문하는 구조적 프로테오믹스에서 귀중한 도구가 되었습니다. 최근에는 하이드록실 라디칼 단백질 풋 프린팅(HRPF) 기술인 FPOP의 범위가 살아있는 세포 배양에서 단백질 라벨링으로 확장되어 복잡한 세포 환경에서 단백질 상호 작용을 연구할 수 있는 수단을 제공하고 있다. 세포 내 단백질 수정은 세포 내의 모든 단백질 복합 형성을 수반하는 리간드 유도된 구조적 변화 또는 형태 변화에 대한 통찰력을 제공할 수 있다. 단백질 발자국은 관례적인 유량 기반 시스템과 248nm KrF 엑시머 레이저를 사용하여 과산화수소의 광분해를 통해 하이드록실 라디칼을 산출하여 한 세포 샘플에 대해 20분의 분석이 필요합니다. 시간 해결 FPOP 실험을 용이하게 하기 위해 새로운 6웰 플레이트 기반 IC-FPOP 플랫폼의 사용이 개척되었습니다. 현재 시스템에서 단일 레이저 펄스는 FPOP 실험 시간 프레임을 잘 하여 20초의 분석 시간, 60배 감소의 결과로 잘 릿비한 하나의 레이저 펄스를 조사합니다. 이러한 분석 시간이 크게 감소하면 생화학 적 신호 캐스케이드, 단백질 접이식 및 차동 실험 (즉, 약물 이없는 약물 바인딩)과 같은 세포 메커니즘을 시간 의존적 방식으로 연구 할 수 있습니다. 이동식 XY 스테이지(PIXY)가 장착된 플랫폼 인큐베이터라는 제목의 이 새로운 계측기를 통해 사용자는 온도, CO2 및 습도 제어가 가능한 플랫폼 인큐베이터를 사용하여 광학 벤치에서 셀 배양 및 IC-FPOP를 직접 수행할 수 있습니다. 이 플랫폼에는 레이저 빔 가이던스를 위한 포지셔닝 스테이지, 연동 펌프 및 미러 광학도 포함되어 있습니다. 광학 구성, 유량, 일시적인 과도 및 PIXY의 H2 O2농도와 같은 IC-FPOP 조건이 최적화되고 피어 검토를 했습니다. 시스템의 모든 구성 요소를 자동화하면 사람의 조작을 줄이고 처리량을 늘릴 수 있습니다.

Explore More Videos

171

This article has been published

Video Coming Soon

JoVE Logo

Privacy

Terms of Use

Policies

Research

Education

ABOUT JoVE

Copyright © 2024 MyJoVE Corporation. All rights reserved