Abstract
Biochemistry
질량 분광법(MS)과 결합된 단백질(FPOP)의 빠른 광화학 적 산화는 용매 접근성의 함수로서 단백질 상호 작용, 구조 및 단백질 형성 역학을 심문하는 구조적 프로테오믹스에서 귀중한 도구가 되었습니다. 최근에는 하이드록실 라디칼 단백질 풋 프린팅(HRPF) 기술인 FPOP의 범위가 살아있는 세포 배양에서 단백질 라벨링으로 확장되어 복잡한 세포 환경에서 단백질 상호 작용을 연구할 수 있는 수단을 제공하고 있다. 세포 내 단백질 수정은 세포 내의 모든 단백질 복합 형성을 수반하는 리간드 유도된 구조적 변화 또는 형태 변화에 대한 통찰력을 제공할 수 있다. 단백질 발자국은 관례적인 유량 기반 시스템과 248nm KrF 엑시머 레이저를 사용하여 과산화수소의 광분해를 통해 하이드록실 라디칼을 산출하여 한 세포 샘플에 대해 20분의 분석이 필요합니다. 시간 해결 FPOP 실험을 용이하게 하기 위해 새로운 6웰 플레이트 기반 IC-FPOP 플랫폼의 사용이 개척되었습니다. 현재 시스템에서 단일 레이저 펄스는 FPOP 실험 시간 프레임을 잘 하여 20초의 분석 시간, 60배 감소의 결과로 잘 릿비한 하나의 레이저 펄스를 조사합니다. 이러한 분석 시간이 크게 감소하면 생화학 적 신호 캐스케이드, 단백질 접이식 및 차동 실험 (즉, 약물 이없는 약물 바인딩)과 같은 세포 메커니즘을 시간 의존적 방식으로 연구 할 수 있습니다. 이동식 XY 스테이지(PIXY)가 장착된 플랫폼 인큐베이터라는 제목의 이 새로운 계측기를 통해 사용자는 온도, CO2 및 습도 제어가 가능한 플랫폼 인큐베이터를 사용하여 광학 벤치에서 셀 배양 및 IC-FPOP를 직접 수행할 수 있습니다. 이 플랫폼에는 레이저 빔 가이던스를 위한 포지셔닝 스테이지, 연동 펌프 및 미러 광학도 포함되어 있습니다. 광학 구성, 유량, 일시적인 과도 및 PIXY의 H2 O2농도와 같은 IC-FPOP 조건이 최적화되고 피어 검토를 했습니다. 시스템의 모든 구성 요소를 자동화하면 사람의 조작을 줄이고 처리량을 늘릴 수 있습니다.
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