Limpando o Ambiente Urbano - Um Pipeline para Amostragem e Detecção de SARS-CoV-2 de Reservatórios Ambientais

Para controlar a transmissão comunitária da síndrome respiratória aguda grave coronavírus 2 (SARS-CoV-2) durante a pandemia global de 2020, a maioria dos países implementou estratégias baseadas em testes humanos diretos, cobertura facial e desinfecção da superfície. Sob o pressuposto de que a principal rota de transmissão inclui aerossóis e gotículas respiratórias, os esforços para detectar SARS-CoV-2 em fomites se concentraram em locais suspeitos de alta prevalência (por exemplo, enfermarias hospitalares, navios de cruzeiro e sistemas de transporte de massa). Para investigar a presença de SARS-CoV-2 em superfícies no ambiente urbano que raramente são limpas e raramente desinfetadas, 350 cidadãos foram alistados do grande condado de San Diego. No total, esses cientistas cidadãos coletaram 4.080 amostras. Uma plataforma online foi desenvolvida para monitorar a entrega e coleta do kit de amostragem, bem como para coletar dados amostrais. Os kits de amostragem foram construídos principalmente a partir de suprimentos disponíveis em lojas com estresse pandêmico. As amostras foram processadas com reagentes de fácil acesso, apesar da recorrente escassez de oferta. Os métodos utilizados foram altamente sensíveis e resistentes aos inibidores comumente presentes em amostras ambientais. Os métodos experimentais de design e processamento propostos foram bem sucedidos em envolver numerosos cientistas cidadãos que efetivamente coletaram amostras de diversas áreas de superfície. O fluxo de trabalho e os métodos aqui descritos são relevantes para o levantamento do ambiente urbano para outros vírus, que são de interesse da saúde pública e representam uma ameaça para futuras pandemias.