Høsting og disaggregation: Et oversett skritt i biofilmmetoder Forskning

Biofilmmetoder består av fire forskjellige trinn: å dyrke biofilmen i en relevant modell, behandle den modne biofilmen, høste biofilmen fra overflaten og dele opp klumpene og analysere prøven. Av de fire trinnene er høsting og disaggregering minst studert, men likevel kritisk når man vurderer potensialet for testbias. Denne artikkelen demonstrerer ofte brukte høstings- og disaggregeringsteknikker for biofilm dyrket på tre forskjellige overflater. De tre biofilmhøstings- og disaggregatasjonsteknikkene, hentet fra en omfattende litteraturgjennomgang, inkluderer virvel- og sonikering, skraping og homogenisering, og skraping, virveling og sonikering. To overflatetyper vurderes: hard ikke-porøs (polykarbonat og borosilikatglass) og porøst (silikon). I tillegg gir vi anbefalinger for minimumsinformasjonen som bør inkluderes når du rapporterer høstingsteknikken som følges og en tilhørende metode for å se etter skjevheter.