Skörd och disagregering: Ett förbisett steg i biofilmsmetoder Forskning

Biofilmsmetoder består av fyra distinkta steg: att odla biofilmen i en relevant modell, behandla den mogna biofilmen, skörda biofilmen från ytan och dela upp klumpar och analysera provet. Av de fyra stegen är skörden och uppdelningen de minst studerade men ändå kritiska när man överväger potentialen för testbias. Denna artikel visar vanliga skörde- och disagregeringstekniker för biofilm som odlas på tre olika ytor. De tre biofilm skörd och disaggregering tekniker, hämtat från en omfattande litteratur översyn, inkluderar virvel och ultraljudsbehandling, skrapning och homogenisering och skrapning, virvel och ultraljudsbehandling. Två yttyper beaktas: hårt icke-poröst (polykarbonat och borosilikatglas) och poröst (silikon). Dessutom ger vi rekommendationer för den minsta information som bör inkluderas vid rapportering av den skördande teknik som följts och en medföljande metod för att kontrollera om det finns partiskhet.