Analisando experimentos multifatoriais de RNA-Seq com o DiCoExpress

O uso adequado da modelagem estatística na análise de dados do NGS requer um nível avançado de expertise. Recentemente, houve um consenso crescente sobre o uso de modelos lineares generalizados para análise diferencial dos dados do RNA-Seq e a vantagem dos modelos de mistura para realizar análises de co-expressão. Para oferecer uma configuração gerenciada para usar essas abordagens de modelagem, desenvolvemos o DiCoExpress que fornece um pipeline R padronizado para realizar uma análise RNA-Seq. Sem qualquer conhecimento particular em estatística ou programação R, os iniciantes podem realizar uma análise completa do RNA-Seq desde controles de qualidade até a co-expressão através da análise diferencial baseada em contrastes dentro de um modelo linear generalizado. Uma análise de enriquecimento é proposta tanto nas listas de genes expressos diferencialmente, quanto nos aglomerados genéticos co-expressos. Este tutorial de vídeo é concebido como um protocolo passo-a-passo para ajudar os usuários a tirar proveito total do DiCoExpress e seu potencial em capacitar a interpretação biológica de um experimento RNA-Seq.