Dendritik Dalların Otomatik Tanımlanması ve Oryantasyonları

Nöronal dendritik ağaçların yapısı, sinaptik girdilerin nöronlara entegrasyonunda kilit rol oynar. Bu nedenle, nöronal fonksiyonun daha iyi anlaşılması için dendritlerin morfolojisinin karakterizasyonu esastır. Bununla birlikte, hem izole edildiğinde hem de özellikle nöronal ağlar içinde bulunduğunda, dendritik ağaçların karmaşıklığı tam olarak anlaşılamamıştır. 2B nöronal kültürlerin floresan görüntülerinden dendritik dalların yönünün otomatik olarak ölçülmesine izin veren yeni bir hesaplama aracı olan SOA 'yı (Segmentasyon ve Oryantasyon Analizi) geliştirdik. Python ile yazılan SOA, dendritik dalları görüntü arka planından ayırmak için segmentasyon kullanır ve her dalın uzamsal yönü üzerinde bir veritabanı biriktirir. Veritabanı daha sonra bir ağdaki dendritik dalların yönlü dağılımı ve paralel dendritik dal büyümesinin yaygınlığı gibi morfolojik parametreleri hesaplamak için kullanılır. Elde edilen veriler, nöronal aktiviteye yanıt olarak dendritlerdeki yapısal değişiklikleri tespit etmek ve biyolojik ve farmakolojik uyaranlara karşı kullanılabilir.