Abstract
Biology
फॉर्मलिन-फिक्स्ड पैराफिन-एम्बेडेड (एफएफपीई) ऊतकों में दूषित गैर-ट्यूमर ऊतकों की उपस्थिति जीनोमिक अध्ययनों को बहुत कमजोर कर सकती है। यहां हम मैक्रोडिसेक्शन का वर्णन करते हैं, एक विधि जिसे डाउनस्ट्रीम न्यूक्लिक एसिड निष्कर्षण करने से पहले अवांछित ऊतक को हटाकर और समाप्त करके ऊतक नमूने की प्रतिशत ट्यूमर सामग्री को बढ़ाने के लिए डिज़ाइन किया गया है। एफएफपीई ऊतक ब्लॉक 4-5 μm स्लाइड-घुड़सवार ऊतक वर्गों का उत्पादन करने के लिए विभाजित थे। हेमटॉक्सिलिन और ईओसिन (एच एंड ई) धुंधला होने के लिए एक प्रतिनिधि अनुभाग प्रस्तुत किया गया था और बाद में एक बोर्ड-प्रमाणित रोगविज्ञानी द्वारा समीक्षा की गई थी। समीक्षा के दौरान, रोगविज्ञानी ने एच एंड ई में ट्यूमर ऊतक के क्षेत्रों की पहचान की और चिह्नित किया। एक बार पूरा होने के बाद, चिह्नित एच एंड ई का उपयोग एक ही ऊतक ब्लॉक से धारावाहिक के लकीर को निर्देशित करने के लिए किया गया था। मैक्रोडिसेक्शन के प्रभावों को प्रदर्शित करने के लिए, मिलान किए गए मैक्रोडिसेक्टेड और गैर-विच्छेदित फैलाना बड़े बी-सेल लिंफोमा (डीएलबीसीएल) से निकाले गए आरएनए को डीएलबीसीएल उपप्रकार और बीसीएल 2 अनुवाद स्थिति निर्धारित करने में सक्षम डिजिटल जीन अभिव्यक्ति परख पर चलाया गया था। परिणामों से पता चला है कि मैक्रोडिसेक्शन ने जांच किए गए नमूनों में से 60% में उपप्रकार या बीसीएल 2 अनुवाद स्थिति कॉल को बदल दिया। अंत में, न्यूक्लिक एसिड निष्कर्षण से पहले ट्यूमर संवर्धन करने के लिए मैक्रोडिसेक्शन एक सरल और प्रभावी तरीका है, जिसके उत्पाद को तब डाउनस्ट्रीम जीनोमिक अध्ययनों में आत्मविश्वास से उपयोग किया जा सकता है।
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