大肠杆菌中天然偶联质粒介导的水平基因转移检测

偶联是促进革兰氏阴性细菌水平基因转移的主要机制之一。这项工作描述了以两个天然存在的质粒为例，描述了研究天然存在的共轭质粒动员的方法。这些方案依赖于供体、受体和共轭质粒中可选标记物的差异存在。具体而言，所描述的方法包括1）鉴定天然偶联质粒，2）固体培养中偶联速率的定量，以及3）通过聚合酶链反应（PCR）诊断检测转缀受体中的抗生素抗性基因和质粒复制子类型。这里描述的方案是在研究水平基因转移的进化生态学的背景下开发的，以筛选环境中发现的细菌中携带抗生素抗性基因的共轭质粒的存在。在这些培养实验中观察到的共轭质粒的有效转移突出了偶联作为促进水平基因转移的机制的生物学相关性，特别是抗生素耐药性的传播。