大腸菌における天然接合プラスミドを介した遺伝子水平伝播の検出

抱合は、グラム陰性菌の水平遺伝子導入を促進する主要なメカニズムの1つです。この研究では、2つの天然に存在するプラスミドを例として使用して、天然に存在する接合プラスミドの動員を研究する方法について説明します。これらのプロトコルは、ドナー、レシピエント、および接合プラスミドにおける選択可能なマーカーの異なる存在に依存しています。具体的には、記載される方法には、1)天然の接合プラスミドの同定、2)固体培養における抱合速度の定量、および3)ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)によるトランスコンジュガントレシピエントにおける抗生物質耐性遺伝子およびプラスミドレプリコンタイプの診断的検出が含まれる。ここで説明するプロトコルは、環境中に見られる細菌における抗生物質耐性遺伝子を運ぶ接合プラスミドの存在をスクリーニングするために、水平遺伝子導入の進化生態学を研究するという文脈で開発されました。培養におけるこれらの実験で観察された接合プラスミドの効率的な転写は、一般的な遺伝子水平伝播、特に抗生物質耐性の拡大を促進するメカニズムとしての接合の生物学的関連性を強調しています。