En proteinsuspension-fældende prøveforberedelse til tåreproteomics ved væskekromatografi-tandemmassespektrometri

Tårevæske er en af de let tilgængelige biofluider, der kan opsamles ikke-invasivt. Tåreproteomics har potentialet til at opdage biomarkører for flere okulære sygdomme og tilstande. Det er rapporteret, at suspensionsfældekolonnen er en effektiv og brugervenlig arbejdsgang til prøveforberedelse til bred anvendelse af proteomisk analyse nedstrøms. Alligevel er denne strategi ikke blevet godt undersøgt i analysen af humant tåreproteom. Denne protokol beskriver en integreret arbejdsgang fra kliniske humane tåreprøver til oprensede peptider til ikke-invasiv tåreproteinbiomarkørforskning ved hjælp af massespektrometri, som giver indsigt i sygdomsbiomarkører og overvågning, når de kombineres med bioinformatikanalyse. En proteinsuspensionsfangeprøveforberedelse blev anvendt og demonstrerede opdagelsen af tåreproteom med hurtige, reproducerbare og brugervenlige procedurer som en universel, optimeret prøveforberedelse til human tårevæskeanalyse. Især suspensionsfangstproceduren overgik prøveforberedelse i opløsning med hensyn til peptidgenvinding, proteinidentifikation og kortere prøveforberedelsestid.